RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471759.5

RABGGTB-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 2,137 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-208ENST00000471759 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GRIFINA4D1Z8 144 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFP92A6NM28 416 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CD300LBA8K4G0 201 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF850A8MQ14 1090 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FABP5P3A8MUU1 101 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ST8SIA3O43173 380 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DHHO43323 396 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PITX3O75364 302 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CER1O95813 267 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADRA2CP18825 462 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HRH1P35367 487 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LHX2P50458 406 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CD226Q15762 336 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZFAND6Q6FIF0 208 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 WDR5BQ86VZ2 330 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR2L13Q8N349 312 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SCCPDHQ8NBX0 429 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR8B12Q8NGG6 310 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR51E1Q8TCB6 317 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PIGTQ969N2 578 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TM2D1Q9BX74 207 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CRLS1Q9UJA2 301 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 WIPF3A6NGB9 483 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SMIM9A6NGZ8 99 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GLOD5A6NK44 160 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CEBPZOSA8MTT3 80 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ISLRO14498 428 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CT45A10P0DMU9 189 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SLC25A6P12236 298 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 IGLL1P15814 213 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 RHOQP17081 205 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CD52P31358 61 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR183P32249 361 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GPR1P46091 355 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SGSHP51688 502 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PLP2Q04941 152 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DUSP2Q05923 314 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF74Q16587 644 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KIAA1644Q3SXP7 199 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TEX29Q8N6K0 151 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10D3Q8NH80 312 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SGMS2Q8NHU3 365 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 C18orf32Q8TCD1 76 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 KXD1Q9BQD3 176 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 STRADBQ9C0K7 418 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MED29Q9NX70 200 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SPANXCQ9NY87 97 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PLA2G3Q9NZ20 509 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MED31Q9Y3C7 131 aa5.66□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1B0GUS0 222 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 A0A1W2PPM0 123 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MEGF11A6BM72 1044 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 H3BUT2 72 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PLPP3O14495 311 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TNFSF12O43508 249 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SYNGR1O43759 233 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 GYPAP02724 150 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MT-ND6P03923 174 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HPNP05981 417 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 DBIP07108 87 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CRYBB3P26998 211 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 HTR1DP28221 377 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CCKBRP32239 447 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CFHR2P36980 270 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 UQCRFS1P47985 274 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PAX9P55771 341 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADIGQ0VDE8 80 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PDE7AQ13946 482 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 PDCD1Q15116 288 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 ZNF439Q8NDP4 499 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 OR10G6Q8NH81 332 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MBD3L1Q8WWY6 194 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 FGF13Q92913 245 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 C5orf66Q9H5L9 145 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CALHM2Q9HA72 323 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 CKLFQ9UBR5 152 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa5.65□□□□□ -1.5
RABGGTB-208ENST00000471759 SCN1AP35498 2009 aa5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms