RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 CATP04040 527 aaKnown RBP-1.12□□□□□ -2.59
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SHQ1-204ENST00000468347 SPRR2AP35326 72 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 PSMB2P49721 201 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 AP1S2P56377 157 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 TAS2R30P59541 319 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 ACTBP60709 375 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 RAB14P61106 215 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 ACTG1P63261 375 aa-1.12□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 RAB31Q13636 194 aa-1.12□□□□□ -2.59
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SHQ1-204ENST00000468347 AKR1C1Q04828 323 aa-1.13□□□□□ -2.59
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SHQ1-204ENST00000468347 C15orf41Q9Y2V0 281 aa-1.13□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP-1.13□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 TIMM9Q9Y5J7 89 aa-1.13□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 SPTA1P02549 2419 aa-1.13□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 KIF13BQ9NQT8 1826 aa-1.13□□□□□ -2.59
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SHQ1-204ENST00000468347 LAMA3Q16787 3333 aa-1.14□□□□□ -2.59
SHQ1-204ENST00000468347 NRCAMQ92823 1304 aa-1.14□□□□□ -2.59
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