RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466490.6

SRPRB-201, Transcript of SRP receptor subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SRPRB, Length 2,827 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRB-201ENST00000466490 RAB7AP51149 207 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C7orf61Q8IZ16 206 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MSL2Q9HCI7 577 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 WNT16Q9UBV4 365 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PDE6DO43924 150 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LRP11Q86VZ4 500 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SGMS2Q8NHU3 365 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM38BQ9NVV0 291 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa11.44□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 HSPB6O14558 160 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PLA2G5P39877 138 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PSG4Q00888 419 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 FFAR4Q5NUL3 377 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C11orf42Q8N5U0 333 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 HSPB9Q9BQS6 159 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TMEM147Q9BVK8 224 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 GRIFINA4D1Z8 144 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 DKK1O94907 266 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PATE4P0C8F1 98 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CD38P28907 300 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MPLP40238 635 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 OR5AU1Q8NGC0 362 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 VN1R17PQ8TDU5 208 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 OR5P3Q8WZ94 311 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SPSB4Q96A44 273 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SLC35E1Q96K37 410 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa11.43□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 EML6Q6ZMW3 1958 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 KRASP01116 189 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CHRNB4P30926 498 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LINC00310P59036 64 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MSMO1Q15800 293 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PRAMEF20Q5VT98 475 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TCF23Q7RTU1 214 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SFRP2Q96HF1 295 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LMO7DNF2Z398 122 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 DUX1O43812 170 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CLDN1O95832 211 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CDKN1AP38936 164 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TFPI2P48307 235 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LHX2P50458 406 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 GNB1P62873 340 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF585BQ52M93 769 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CPT1CQ8TCG5 803 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 OR2H1Q9GZK4 316 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 WNT5BQ9H1J7 359 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 WIPI2Q9Y4P8 454 aa11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CHCHD2Q9Y6H1 151 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LINC01565O15544 149 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 IGLV2-14P01704 120 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C1QTNF9P0C862 333 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 B4GALT1P15291 398 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C20orf204Q6ZNR8 217 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 KMT5CQ86Y97 462 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 OR4B1Q8NGF8 309 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CHODLQ9H9P2 273 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 DOCK11Q5JSL3 2073 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CBR3O75828 277 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SERF1AO75920 110 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SERPINA7P05543 415 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CRISP2P16562 243 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 COMPP49747 757 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PMP22Q01453 160 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 F6UZH7 168 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 RABEPKQ7Z6M1 372 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 CIB3Q96Q77 187 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 KCNIP2Q9NS61 270 aa11.41□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 TRAPPC2LH3BP13 241 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 DEGS1O15121 323 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SYNGR4O95473 234 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PCBD1P61457 104 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 RAET1LQ5VY80 246 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MKXQ8IYA7 352 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 ZNF709Q8N972 641 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 MTCH1Q9NZJ7 389 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa11.4□□□□□ -0.58
SRPRB-201ENST00000466490 C20orf202A1L168 122 aa11.4□□□□□ -0.59
SRPRB-201ENST00000466490 NDUFB4O95168 129 aa11.4□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms