RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463533.1

ANKRD28-208, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD28, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-208ENST00000463533 AJUBAQ96IF1 538 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 YPEL2Q96QA6 119 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 GINS4Q9BRT9 223 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RDH8Q9NYR8 311 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 M0QYG6 137 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 IGLV1-47P01700 117 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CTXN2P0C2S0 81 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HRH1P35367 487 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR3A3P47888 321 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RFX2P48378 723 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CDK10Q15131 360 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DEFB112Q30KQ8 113 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MIDNQ504T8 468 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LYG1Q8N1E2 194 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 Q8N402 240 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LINC00311Q8N616 119 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF596Q8TC21 504 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SLC6A7Q99884 636 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SRRQ9GZT4 340 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MMP28Q9H239 520 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 NECAP2Q9NVZ3 263 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RNF150Q9ULK6 438 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.81□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LY6LH3BQJ8 138 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CD3DP04234 171 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8U9P0C7N5 309 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR5H8P0DN80 308 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MED14OSP0DP75 135 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 AADACP22760 399 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 HTR1DP28221 377 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 FCGR2CP31995 323 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS2R46P59540 309 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 BPIFB3P59826 476 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTBP60709 375 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ACTG1P63261 375 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF45Q02386 682 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SSX2Q16385 188 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 Q3ZCU0 254 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 PLA1AQ53H76 456 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 C9orf139Q6ZV77 190 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ODF3L1Q8IXM7 274 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TMEM229BQ8NBD8 167 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR2AK2Q8NG84 335 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR10X1Q8NGY0 326 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 OR8U1Q8NH10 309 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ABHD14BQ96IU4 210 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 IFI27L2Q9H2X8 130 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 EHFQ9NZC4 300 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DPM3Q9P2X0 92 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 LEUTXA8MZ59 168 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DIRAS3O95661 229 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB3DO95716 219 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 CSF1P09603 554 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 FAM157CP0CG43 387 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 IGKV1-13P0DP09 117 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 REG1BP48304 166 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RAB13P51153 203 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TAS2R19P59542 299 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 TSPAN5P62079 268 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 DYRK1AQ13627 763 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 BAK1Q16611 211 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.79□□□□□ -1.32
ANKRD28-208ENST00000463533 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.5 ms