RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462155.2

IFRD1-210, Transcript of interferon related developmental regulator 1, human

TSL 5

Gene IFRD1, Length 437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IFRD1-210	ENST00000462155	KIR2DS2	P43631	304 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR3A3	P47888	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	LGALS7	P47929	136 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	MNAT1	P51948	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	STEAP3	Q658P3	488 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR10H4	Q8NGA5	316 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	CPNE2	Q96FN4	548 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GPER1	Q99527	375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	COA4	Q9NYJ1	87 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TECR	Q9NZ01	308 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SELENOK	Q9Y6D0	94 aa		4.85	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155		M0R129	80 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	UBE2C	O00762	179 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GNGT2	O14610	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SLC22A1	O15245	554 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	RTL8C	O15255	209 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SULT1B1	O43704	296 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	CST1	P01037	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	MT-ND4	P03905	459 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	FOLR2	P14207	255 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	CTRB1	P17538	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ATP6V1B2	P21281	511 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ATP6V1E1	P36543	226 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	RPS16	P62249	146 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ALKBH1	Q13686	389 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GK3P	Q14409	553 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GNMT	Q14749	295 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	FXYD3	Q14802	87 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	MORN2	Q502X0	79 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	C6orf141	Q5SZD1	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	CTRB2	Q6GPI1	263 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	KCTD20	Q7Z5Y7	419 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	STPG3	Q8N7X2	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	OR4K15	Q8NH41	348 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	THRSP	Q92748	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	GHSR	Q92847	366 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	USMG5	Q96IX5	58 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	PRRG3	Q9BZD7	231 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
IFRD1-210	ENST00000462155	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	C2orf70	A6NJV1	201 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155		M0R2N4	97 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	BMPR1B	O00238	502 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	GABRP	O00591	440 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	RBBP9	O75884	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	ISG15	P05161	165 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2T7	P0C7T2	308 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	EDN2	P20800	178 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	EXOSC2	Q13868	293 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	PSG5	Q15238	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	ZNF57	Q68EA5	555 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	GID4	Q8IVV7	300 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	TMEM61	Q8N0U2	210 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR52N1	Q8NH53	320 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	WASHC3	Q9Y3C0	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.82	□□□□□ -1.64
IFRD1-210	ENST00000462155	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		4.82	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms