RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441439.6

LMO3-208, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,515 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-208ENST00000441439 NRN1LQ496H8 165 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 COLCA1Q6ZS62 124 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 C19orf35Q6ZS72 473 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 ZNF442Q9H7R0 627 aa6.66□□□□□ -1.34
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LMO3-208ENST00000441439 ZNF585BQ52M93 769 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.65□□□□□ -1.34
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LMO3-208ENST00000441439 ZPBPQ9BS86 351 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 LRRC61Q9BV99 259 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 C1RLQ9NZP8 487 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 CACNG5Q9UF02 275 aa6.65□□□□□ -1.34
LMO3-208ENST00000441439 MYO7BQ6PIF6 2116 aa6.65□□□□□ -1.34
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LMO3-208ENST00000441439 WDR73Q6P4I2 378 aa6.65□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 MOB1BQ7L9L4 216 aa6.65□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 PMCHL1Q16048 86 aa6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 PAGE4O60829 102 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 CARD17Q5XLA6 110 aa6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 LYG1Q8N1E2 194 aa6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 RDH5Q92781 318 aa6.64□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.63□□□□□ -1.35
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LMO3-208ENST00000441439 ARG2P78540 354 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 MMDQ15546 238 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 RASL11AQ6T310 242 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 MUC15Q8N387 334 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 WDR31Q8NA23 367 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 VN1R17PQ8TDU5 208 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 UHRF2Q96PU4 802 aa6.63□□□□□ -1.35
LMO3-208ENST00000441439 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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