RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 TM2D1Q9BX74 207 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CLEC7AQ9BXN2 247 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNK15Q9H427 330 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ING3Q9NXR8 418 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TAS2R8Q9NYW2 309 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CALYQ9NYX4 217 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TBC1D24Q9ULP9 559 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa8.7□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0A6YYD4 124 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 C15orf65H3BRN8 121 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SULT1C2O00338 296 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHST1O43916 411 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDCD6O75340 191 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MT-ND4P03905 459 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS3P35030 304 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSTR5P35346 364 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAUP35544 74 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 GLP1RP43220 463 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DYNLT3P51808 116 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DGCR2P98153 550 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 NRARPQ7Z6K4 114 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RTN4RL2Q86UN3 420 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF565Q8N9K5 539 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DPF1Q92782 380 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRSS22Q9GZN4 317 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 C11orf54Q9H0W9 315 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PITPNC1Q9UKF7 332 aa8.69□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV39A0A0B4J263 110 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 LY6LH3BQJ8 138 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 LDLRAD4O15165 306 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CA11O75493 328 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CD3GP09693 182 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 FUT3P21217 361 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 CHATP28329 748 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DYRK1AQ13627 763 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARL6IP1Q15041 203 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLET1Q6UQ28 207 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM89BQ8N5H3 189 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR56B1Q8NGI3 324 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRGPRDQ8TDS7 321 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DEDD2Q8WXF8 326 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPP1R14BQ96C90 147 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 NICN1Q9BSH3 213 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM59Q9BXS4 323 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPAR5Q9H1C0 372 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF702PQ9H963 129 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SCPEP1Q9HB40 452 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa8.68□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM172BPA6NC97 362 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MCRIP1C9JLW8 97 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BUI4 141 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 K7EIL1 84 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 F2RL2O00254 374 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLA2G10O15496 165 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ORC5O43913 435 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 GZMHP20718 246 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 HTR1DP28221 377 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 BCAP31P51572 246 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ACTBP60709 375 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSX2Q16385 188 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 HLA-DRB5Q30154 266 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM219Q86XT9 240 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR52I2Q8NH67 350 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF596Q8TC21 504 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRIM63Q969Q1 353 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 AUNIPQ9H7T9 357 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SERTAD4Q9NUC0 356 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 ETAA1Q9NY74 926 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 COPZ2Q9P299 210 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 TCF19Q9Y242 345 aa8.67□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 C12orf77C9JDV5 145 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 LANCL1O43813 399 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 LPLP06858 475 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPNP16150 400 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 RCVRNP35243 200 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 VEGFCP49767 419 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.66□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.7 ms