RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428584.5

TTC28-AS1-207, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC28-AS1, Length 5,859 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A8MWL6 223 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR2H2O95918 312 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 UCP2P55851 309 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CALHM1Q8IU99 346 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 REG1BP48304 166 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 P2RY6Q15077 328 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RSG1Q9BU20 258 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LTBP4Q8N2S1 1624 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 M0R3E3 92 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM171Q8WVE6 324 aa12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP12.91□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CD74P04233 296 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ID4P47928 161 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TEX29Q8N6K0 151 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCNM1Q9BWG6 230 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NDUFB4O95168 129 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMY1AP04745 511 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 P2RY4P51582 365 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MFAP2P55001 183 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SMUG1Q53HV7 270 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TP53RKQ96S44 253 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RABAC1Q9UI14 185 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FCARP24071 287 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SCTP09683 121 aa12.9□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NMUP48645 174 aa12.9□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPATA45Q537H7 98 aa12.9□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1P1Q8NH06 330 aa12.9□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC25A38Q96DW6 304 aa12.9□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MC5RP33032 325 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF273Q14593 569 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KCNMB1Q16558 191 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HSPB9Q9BQS6 159 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HTN1P15515 57 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCSHP23434 173 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SELENOTP62341 195 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 COL24A1Q17RW2 1714 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL21O00585 134 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TRGC2P03986 189 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4B1Q8NGF8 309 aa12.89□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRSS53Q2L4Q9 553 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR1N2Q8NGR9 330 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PKIBQ9C010 78 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 A6NJY4 79 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AHRRA9YTQ3 701 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM206AQ9NX38 181 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TCF21O43680 179 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 HLA-DQA1P01909 254 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SAXO1Q8IYX7 474 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM45BQ96B21 275 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 AMELYQ99218 206 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CCL13Q99616 98 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PMCHL1Q16048 86 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 RAB37Q96AX2 223 aa12.88□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 IGHMP01871 453 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FGF5P12034 268 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MDKP21741 143 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 LINC00869P0C866 280 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 MAS1LP35410 378 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 OR4A47Q6IF82 309 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 FAM214BQ7L5A3 538 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PCGF1Q9BSM1 259 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KBTBD11O94819 623 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 KLK2P20151 261 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 WFDC3Q8IUB2 231 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 GPR146Q96CH1 333 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SYT8Q8NBV8 401 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 CXorf65A6NEN9 183 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PRR33A8MZF0 331 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 PATE3B3GLJ2 98 aa12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
TTC28-AS1-207ENST00000428584 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms