RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428450.5

DDX39B-209, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 4

Gene DDX39B, Length 633 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-209ENST00000428450 USMG5Q96IX5 58 aa8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RAB9BQ9NP90 201 aa8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 SELENOKQ9Y6D0 94 aa8.52□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CDRT1O95170 752 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RAP2AP10114 183 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CCR9P51686 369 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MS4A2Q01362 244 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ATAD3CQ5T2N8 411 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 C6orf183Q5T699 404 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 SERPINA12Q8IW75 414 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DEFB107AQ8IZN7 70 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 PARP16Q8N5Y8 322 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 C2CD4CQ8TF44 421 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RNF5Q99942 180 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FAM192AQ9GZU8 254 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 NDE1Q9NXR1 346 aa8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 A0A0B4J203 849 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR4C45A6NMZ5 311 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 H0YJW9 148 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 UBE2CO00762 179 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 SLC22A1O15245 554 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 YPEL1O60688 119 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RBBP9O75884 186 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 IFNA4P05014 189 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RPSAP08865 295 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CTRB1P17538 263 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 APOC4P55056 127 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MPV17LQ2QL34 196 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TM4SF20Q53R12 229 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 LY6G6FQ5SQ64 297 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CTRB2Q6GPI1 263 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FAM71F2Q6NXP2 309 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF529Q6P280 563 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FAM220AQ7Z4H9 259 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 LINC00596Q86U02 117 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GID4Q8IVV7 300 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR52B4Q8NGK2 314 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 NEK7Q8TDX7 302 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 YPEL2Q96QA6 119 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 IL4I1Q96RQ9 567 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 IFI27L2Q9H2X8 130 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 VCXQ9H320 206 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TAF9BQ9HBM6 251 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 IL36GQ9NZH8 169 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 JPT1Q9UK76 154 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ING4Q9UNL4 249 aa8.5□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR5H14A6NHG9 310 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DCTN3O75935 186 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 EPHA2P29317 976 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MC5RP33032 325 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RPL39P5Q59GN2 51 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 C12orf73Q69YU5 71 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DHFR2Q86XF0 187 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 STX19Q8N4C7 294 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR5AN1Q8NGI8 311 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 OR51A2Q8NGJ7 313 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CYYR1Q96J86 154 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GPER1Q99527 375 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TSC22D3Q99576 134 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FBXL17Q9UF56 701 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 DMRT1Q9Y5R6 373 aa8.49□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 A0A1W2PP11 408 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GNGT2O14610 69 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CBLN1P23435 193 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 HTD2P86397 168 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 PJVKQ0ZLH3 352 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 TMEM68Q96MH6 324 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 PRRG3Q9BZD7 231 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MFFQ9GZY8 342 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 METTL9Q9H1A3 318 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 MLXQ9UH92 298 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 WASHC3Q9Y3C0 194 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.48□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 KIR2DL5BA0A0G2JN68 375 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 KIR2DL5BA0A0G2JPC4 375 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 ZAR1LA6NP61 321 aa8.47□□□□□ -1.05
DDX39B-209ENST00000428450 IGLL5B9A064 214 aa8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.5 ms