RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 CBLN2Q8IUK8 224 aa11.33□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CD40P25942 277 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RFLNBQ8N5W9 214 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SAP25Q8TEE9 199 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TRAV39A0A0B4J263 110 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SIAH2O43255 324 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PRF1P14222 555 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 COX6B1P14854 86 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 POM121Q96HA1 1249 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 MYO16Q9Y6X6 1858 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 MIA3Q5JRA6 1907 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TRIP11Q15643 1979 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 A8MWL6 223 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 WNT9BO14905 357 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SMIM10L1P0DMW3 83 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PSG9Q00887 426 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM78Q5T7P6 136 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SMIM10Q96HG1 83 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RBKSQ9H477 322 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CD99P14209 185 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PKIAP61925 76 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 FHL5Q5TD97 284 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 FAM206AQ9NX38 181 aa11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZNF207O43670 478 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 GREM1O60565 184 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 IGSF11Q5DX21 431 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 OVCH2Q7RTZ1 564 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SFXN3Q9BWM7 321 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 JPT1Q9UK76 154 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 NPIPB13A6NJU9 1138 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 NPIPB4C9JG80 1138 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 REG1BP48304 166 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RPL8P62917 257 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZNF880Q6PDB4 577 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 A0A087X0M5 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 A0A1B0GX30 115 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 COX6A1P12074 109 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RPS20P60866 119 aaKnown RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 UBE2V2Q15819 145 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LRRC75AQ8NAA5 344 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PIMREGQ9BSJ6 248 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 HLA-DQB1P01920 261 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM54Q969K7 222 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 MIOXQ9UGB7 285 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 A0A1W2PPE3 182 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TWIST1Q15672 202 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ITLN1Q8WWA0 313 aa11.31□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CCL8P80075 99 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SLC16A13Q7RTY0 426 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 TMEM252Q8N6L7 170 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 FAM181AQ8N9Y4 354 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 DNASE2BQ8WZ79 361 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 J3KRW8 73 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 OR8A1Q8NGG7 326 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 FCARP24071 287 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 C19orf24Q9BVV8 132 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 IFITM10A6NMD0 228 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CELA2AP08217 269 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CD300CQ08708 224 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SLC25A45Q8N413 288 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 ELOVL5Q9NYP7 299 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LHFPL6Q9Y693 200 aa11.3□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 SCTP09683 121 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PCSK4Q6UW60 755 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PQLC2Q6ZP29 291 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CALYQ9NYX4 217 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 IL36RNQ9UBH0 155 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 OR5AC2Q9NZP5 309 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CDK2AP1O14519 115 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 CXCL2P19875 107 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 RELBQ01201 579 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 C16orf92Q96LL3 132 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 AQP10Q96PS8 301 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 NRIP2Q9BQI9 281 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 HKR1P10072 659 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 MAS1LP35410 378 aa11.29□□□□□ -0.6
TNS1-205ENST00000419504 PTGDSP41222 190 aa11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms