RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST2H2BEQ16778 126 aa15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP1-202ENST00000417536 Q6P435 159 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2BHQ93079 126 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2BNQ99877 126 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-202ENST00000417536 HIST1H2BMQ99879 126 aa15.8■□□□□ 0.12
SH3BP1-202ENST00000417536 OPA3Q9H6K4 179 aa15.8■□□□□ 0.12
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SH3BP1-202ENST00000417536 C1orf87Q8N0U7 546 aa15.75■□□□□ 0.11
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SH3BP1-202ENST00000417536 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa15.74■□□□□ 0.11
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SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM41BQ5BJD5 291 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ABHD5Q8WTS1 349 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 RBKSQ9H477 322 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 SPTA1P02549 2419 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa15.74■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP1R2P9O14990 202 aa15.73■□□□□ 0.11
SH3BP1-202ENST00000417536 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
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