RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAFIPQ8WZ33 124 aa5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR5P3Q8WZ94 311 aa5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PFDN5Q99471 154 aa5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NICN1Q9BSH3 213 aa5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CST11Q9H112 138 aa5.3□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MLNRO43193 412 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JTBO76095 146 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NXPH2O95156 264 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CST4P01036 141 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MGMTP16455 207 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BCL3P20749 454 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TFF3Q07654 80 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPPED2Q15777 294 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TAF9Q16594 264 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q5BKY6 102 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2B11Q5JQS5 317 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NCMAPQ5T1S8 102 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIQKQ629K1 86 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF841Q6ZN19 808 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZR03 302 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZSV7 163 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MKXQ8IYA7 352 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNG3Q8TAE7 436 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLSCR3Q9NRY6 295 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MLXQ9UH92 298 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAB22AQ9UL26 194 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 E7EQL1 145 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTTG1O95997 202 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ALDOBP05062 364 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SFTPBP07988 381 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GTF2F2P13984 249 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GNB3P16520 340 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDKN1BP46527 198 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNC119Q13432 240 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIGYQ3MUY2 71 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MOGAT2Q3SYC2 334 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf100Q5SVJ3 147 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM42Q69YG0 159 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BIVMQ86UB2 503 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FBXL14Q8N1E6 418 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q8N3U1 123 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C19orf18Q8NEA5 215 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BPIFCQ8NFQ6 507 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NEK7Q8TDX7 302 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TECTBQ96PL2 329 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2V2Q96R30 315 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHARPINQ9H0F6 387 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UBTD1Q9HAC8 227 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ST3GAL6Q9Y274 331 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETV7Q9Y603 341 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AKAP9Q99996 3911 aa5.29□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 APCP25054 2843 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C9orf170A2RU37 121 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM235A6NFC5 223 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHISA9B4DS77 424 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 M0R233 179 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOCS1O15524 211 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC22A5O76082 557 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGKV1D-12P01611 117 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGHV3-13P01766 116 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KITLGP21583 273 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACTBP60709 375 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACTG1P63261 375 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF154Q13106 437 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDNFQ49AH0 187 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SSX8Q7RTT4 187 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf174Q8IYL3 243 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF561Q8N587 486 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITLN1Q8WWA0 313 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SEH1LQ96EE3 360 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C14orf144Q96I85 54 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CXXC4Q9H2H0 198 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C1orf123Q9NWV4 160 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 hDV102S1A0JD36 115 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR5B21A6NL26 309 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 OR2AT4A6NND4 320 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMEM238C9JI98 176 aa5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP5.28□□□□□ -1.56
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LINC00614P0C842 121 aa5.28□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms