RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000328514.11

GINS3-202, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 1,932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-202ENST00000328514 OR10G7Q8NGN6 311 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TBX15Q96SF7 602 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 DIRC2Q96SL1 478 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 FOXB1Q99853 325 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TMEM147Q9BVK8 224 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SRXN1Q9BYN0 137 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PROK2Q9HC23 129 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MTCH1Q9NZJ7 389 aa9.55□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 NPPCP23582 126 aa9.54□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa9.54□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 HSPB7Q9UBY9 170 aa9.54□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 MYO9BQ13459 2157 aa9.54□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 Q6ZS52 159 aa9.54□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 FGFBP3Q8TAT2 258 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SLC25A22Q9H936 323 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 LPAR2Q9HBW0 351 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 IL17BQ9UHF5 180 aa9.54□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 A0A0U1RQK1 487 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ZNF320A2RRD8 509 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 EPOPA6NHQ4 379 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PMS2P5A8MQ11 134 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SOX15O60248 233 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 NUPR1O60356 82 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TIAF1O95411 115 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 UMODP07911 640 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 PATE4P0C8F1 98 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TMEM183BQ1AE95 376 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 MOB1BQ7L9L4 216 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CADM4Q8NFZ8 388 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR56B2PQ8NGI1 322 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 CMTM2Q8TAZ6 248 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 NEK7Q8TDX7 302 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 GATAD1Q8WUU5 269 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 RAB1CQ92928 201 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TXNDC17Q9BRA2 123 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR51B6Q9H340 312 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PKD1L2Q7Z442 2459 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SPTBN4Q9H254 2564 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ABCA7Q8IZY2 2146 aa9.53□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 C11orf94C9JXX5 98 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 PAGE4O60829 102 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 SCRG1O75711 98 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 TPPP2P59282 170 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ANKRD39Q53RE8 183 aa9.52□□□□□ -0.88
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GINS3-202ENST00000328514 Q6ZWC4 215 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 AAED1Q7RTV5 226 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 OR5A2Q8NGI9 324 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 HLA-CQ95604 372 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 KCNIP2Q9NS61 270 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 WNT16Q9UBV4 365 aa9.52□□□□□ -0.88
GINS3-202ENST00000328514 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 LNP1A1A4G5 178 aa9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 F6UZH7 168 aa9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 IFNL4K9M1U5 179 aa9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 CBR3O75828 277 aa9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
GINS3-202ENST00000328514 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP9.52□□□□□ -0.89
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