RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 MS4A5Q9H3V2 200 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 C11orf1Q9H5F2 150 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 KCNJ16Q9NPI9 418 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 MED9Q9NWA0 146 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CALYQ9NYX4 217 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 A0A0G2JRQ6 117 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 SIGLEC5O15389 551 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GPR137BO60478 399 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CGB3P0DN86 165 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CGB7P0DN87 165 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 FAM74A1Q5RGS3 127 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GPR157Q5UAW9 335 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 GPR146Q96CH1 333 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 CXorf58Q96LI9 332 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 RAB9BQ9NP90 201 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD8-201ENST00000313173 A0A1B0GU03 582 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 NKX6-3A6NJ46 265 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 B9A039 149 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 LTC4SQ16873 150 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 MST1LQ2TV78 715 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 FAM216BQ8N7L0 139 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 GNG12Q9UBI6 72 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 FBXL17Q9UF56 701 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 DEFB108AA8MXU0 73 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 YPEL1O60688 119 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 ID3Q02535 119 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CATR1Q13166 79 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 YPEL2Q96QA6 119 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PSG11Q9UQ72 335 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 ROS1P08922 2347 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM178BH3BS89 294 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 ST8SIA5O15466 376 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PITX3O75364 302 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PLAUP00749 431 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM33P57088 247 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 EIF5AP63241 154 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 MORN2Q502X0 79 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 AGMATQ9BSE5 352 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 SIAH2O43255 324 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 LOXL3P58215 753 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TMEM106BQ9NUM4 274 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 DSCAML1Q8TD84 2053 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 EPHA1P21709 976 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 RPL30P62888 115 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 C17orf58Q2M2W7 97 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 SDHAF2Q9NX18 166 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TANC2Q9HCD6 1990 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV1-5P01602 117 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 AKR1C2P52895 323 aa22.23■■□□□ 1.15
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HOXD8-201ENST00000313173 PPIAL4DF5H284 164 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PPIAL4FP0DN26 164 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 MMP9P14780 707 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PPIAL4AQ9Y536 164 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 SSSCA1O60232 199 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 LPAR6P43657 344 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TOR2AQ5JU69 321 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 BTNL3Q6UXE8 466 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TCF23Q7RTU1 214 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 MAGT1Q9H0U3 335 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CLN8Q9UBY8 286 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 PFDN2Q9UHV9 154 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CLDN1O95832 211 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 Q3ZCU0 254 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 OR2C3Q8N628 320 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 CCL17Q92583 94 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD8-201ENST00000313173 TMPRSS2O15393 492 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 CORO2AQ92828 525 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 SMIM3Q9BZL3 60 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 CACNG5Q9UF02 275 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 ITGB1BP1O14713 200 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 JTBO76095 146 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 OMGP23515 440 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 LOXP28300 417 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 GPR12P47775 334 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 VAMP2P63027 116 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 TFF3Q07654 80 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 SWI5Q1ZZU3 235 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 Q6ZRM9 215 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 TMED6Q8WW62 240 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD8-201ENST00000313173 NUP50Q9UKX7 468 aa22.19■■□□□ 1.14
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