RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 CHST1O43916 411 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 RGS11O94810 467 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1-13P0DP09 117 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 HLA-DMAP28067 261 aa7.3□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CEACAM3P40198 252 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 LY6G6FQ5SQ64 297 aa7.3□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 IL18Q14116 193 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 GLDNQ6ZMI3 551 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 CBX5P45973 191 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 ZNF79Q15937 498 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC190Q86UF4 302 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 GPHA2Q96T91 129 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OR2D2Q9H210 308 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 SCPEP1Q9HB40 452 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 A3GALT2U3KPV4 340 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 A6NDX4 124 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 OOSP1A8MZH6 123 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 M0QYG6 137 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 TUSC2O75896 110 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 AANATQ16613 207 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 FAM131AQ6UXB0 335 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 Q6ZS46 218 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 OVCH2Q7RTZ1 564 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 OR4D10Q8NGI6 311 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 FAM216AQ8WUB2 273 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 C19orf24Q9BVV8 132 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 EHFQ9NZC4 300 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4D-201ENST00000309641 MTFP1Q9UDX5 166 aa7.28□□□□□ -1.24
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PDE4D-201ENST00000309641 GABARAPH6UMI1 98 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1-33P01594 117 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 IGLV2-14P01704 120 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CTXN2P0C2S0 81 aa7.27□□□□□ -1.25
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PDE4D-201ENST00000309641 CT45A5P0DMU8 189 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CT45A7P0DMV0 189 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 IL3RAP26951 378 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CDK10Q15131 360 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 PYHIN1Q6K0P9 492 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 OR5R1Q8NH85 324 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 SMIM4Q8WVI0 70 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 FCAMRQ8WWV6 532 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 RITA1Q96K30 269 aa7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
PDE4D-201ENST00000309641 NECAP2Q9NVZ3 263 aa7.27□□□□□ -1.25
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