RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 FCN1O00602 326 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 CA11O75493 328 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 GCGP01275 180 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 PCP4P48539 62 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 RPL23P62829 140 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 SLC23A3Q6PIS1 610 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 C10orf35Q96D05 121 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 OR2D2Q9H210 308 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 TMEM9BQ9NQ34 198 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 SELENOKQ9Y6D0 94 aa13.08□□□□□ -0.31
USP25-201ENST00000285679 C17orf112F2Z3M2 114 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CBR3O75828 277 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NGFP01138 241 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TFPI2P48307 235 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RAC1P63000 192 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 A8MXE2 369 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 FOLR3P41439 243 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NUBP1P53384 320 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CD81P60033 236 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ID3Q02535 119 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TNFRSF9Q07011 255 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 VHLLQ6RSH7 139 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SLC25A45Q8N413 288 aa13.08□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 UCP3P55916 312 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NXPH1P58417 271 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CATR1Q13166 79 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 KIAA1644Q3SXP7 199 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 GNG12Q9UBI6 72 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 H0Y980 276 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 KBTBD11O94819 623 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CRISP2P16562 243 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 UCP1P25874 307 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RPL19P84098 196 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TMEM256Q8N2U0 113 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 LRTM2Q8N967 370 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SSMEM1Q8WWF3 244 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CBY1Q9Y3M2 126 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 GNB2P62879 340 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 PRSS8Q16651 343 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ALKBH6Q3KRA9 238 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 DMRTA1Q5VZB9 504 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ATOH7Q8N100 152 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 MTCH1Q9NZJ7 389 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NUP210LQ5VU65 1888 aa13.07□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 A8MWP6 167 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 OR3A1P47881 315 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TPPP2P59282 170 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ARG2P78540 354 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ARL16Q0P5N6 197 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CBLN1P23435 193 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 HOXA6P31267 233 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 IER3P46695 156 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ERVFC1-1P60608 527 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RAC3P60763 192 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 OR8B8Q15620 311 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 Q6ZRM9 215 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SCRT1Q9BWW7 348 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ACACAQ13085 2346 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CREBBPQ92793 2442 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CEACAM1P13688 526 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 LIFP15018 202 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SERF2P84101 59 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 PRR27Q6MZM9 219 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 WNT5BQ9H1J7 359 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa13.06□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CCKARP32238 428 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 AMTP48728 403 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ENY2Q9NPA8 101 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 MANBALQ9NQG1 85 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NAT8BQ9UHF3 227 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 RNF24Q9Y225 148 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 OR10J1P30954 320 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TCTAP57738 103 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 EXT1Q16394 746 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 FGFRL1Q8N441 504 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ZNF525Q8N782 197 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TMEM56Q96MV1 263 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 SYNGR3O43761 229 aa13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
USP25-201ENST00000285679 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms