RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 IL23AQ9NPF7 189 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 SLC35D1Q9NTN3 355 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 DECR2Q9NUI1 292 aa9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa9.75□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 HYPMO75409 117 aa9.74□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV1D-12P01611 117 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 Q56UQ5 140 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 C3orf80F5H4A9 247 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 SFRP2Q96HF1 295 aa9.74□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 LINC01551Q86U37 167 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 ZNF611Q8N823 705 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 G3V3Y1 287 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 GCSAMLQ5JQS6 135 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 C1orf174Q8IYL3 243 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 NUDT11Q96G61 164 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 C11orf1Q9H5F2 150 aa9.73□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 BLACEA4D250 179 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 DPRXA6NFQ7 191 aa9.72□□□□□ -0.85
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PTPRR-201ENST00000283228 A8MXE2 369 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 IGKV3-11P04433 115 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 CCL1P22362 96 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 PHYHD1Q5SRE7 291 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 STUMQ69YW2 141 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 AGMATQ9BSE5 352 aa9.72□□□□□ -0.85
PTPRR-201ENST00000283228 ODAMA1E959 279 aa9.72□□□□□ -0.85
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