RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273482.10

TRPC1-201, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily C member 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPC1, Length 4,324 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1-201ENST00000273482 RPRMQ9NS64 109 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 FER1L5A0AVI2 2057 aa14.71□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 TAAR6Q96RI8 345 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NPIPB13A6NJU9 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NPIPB4C9JG80 1138 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF506Q5JVG8 444 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SPRY3O43610 288 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HRASP01112 189 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFB7P17568 137 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CD82P27701 267 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SGMS2Q8NHU3 365 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SRXN1Q9BYN0 137 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR2D2Q9H210 308 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 AGFG2O95081 481 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR5B3Q8NH48 314 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR2H1Q9GZK4 316 aa14.7□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 LURAP1LQ8IV03 231 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CBLN4Q9NTU7 201 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PTTG1IPP53801 180 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ASPHD2Q6ICH7 369 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 VN1R17PQ8TDU5 208 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CBY3A6NI87 242 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CD59P13987 128 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PLAURQ03405 335 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ABHD14BQ96IU4 210 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa14.69□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR3A1P47881 315 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 FNDC7Q5VTL7 733 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HEPN1Q6WQI6 88 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CORO2AQ92828 525 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 RAB24Q969Q5 203 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 DENND4CQ5VZ89 1909 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 A0A0A6YYD4 124 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 DNPH1O43598 174 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BKO60814 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BJP06899 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BOP23527 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BBP33778 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BDP58876 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BCP62807 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST2H2BEQ16778 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 EDARADDQ8WWZ3 215 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BHQ93079 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BNQ99877 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 HIST1H2BMQ99879 126 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R45P59539 299 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 DTD1Q8TEA8 209 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 P2RX4Q99571 388 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 RBKSQ9H477 322 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PRR27Q6MZM9 219 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 TMEM183AQ8IXX5 376 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR4C12Q96R67 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 S1PR3Q99500 378 aa14.68□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 WNK2Q9Y3S1 2297 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 H0Y980 276 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 TAS2R60P59551 318 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 Q6ZN92 141 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 GPR146Q96CH1 333 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ACY3Q96HD9 319 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CCL20P78556 96 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 PSG4Q00888 419 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR4C5Q8NGB2 326 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ELOVL1Q9BW60 279 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 DEFB108AA8MXU0 73 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 NPIPB7O75200 414 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 ZNF253O75346 499 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 SELEP16581 610 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 UCP3P55916 312 aa14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 A0A087WWC5 75 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 OR5B21A6NL26 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TRPC1-201ENST00000273482 C9JQL5 133 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59 ms