RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249700.8

TMOD2-201, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD2, Length 9,191 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-201ENST00000249700 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MPTX1A8MV57 137 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LILRA1O75019 489 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 WT1P19544 449 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SIGIRRQ6IA17 410 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ASCL5Q7RTU5 278 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LYG1Q8N1E2 194 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CHRDL1Q9BU40 450 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 XIRP2A4UGR9 3374 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CADP27708 2225 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MSGN1A6NI15 193 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 S100A8P05109 93 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 RBM11P57052 281 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 KIRREL1Q96J84 757 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 UFC1Q9Y3C8 167 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 A0A0D9SG52 128 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TNFSF10P50591 281 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LYZL2Q7Z4W2 148 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LYPD6Q86Y78 171 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 KLHDC1Q8N7A1 406 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 THYN1Q9P016 225 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TMED3Q9Y3Q3 217 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SNAPINO95295 136 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MELTFP08582 738 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 GNLYP22749 145 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 C1RLQ9NZP8 487 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SPG11Q96JI7 2443 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ACACBO00763 2458 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 H3BP45 60 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 BCL2L11O43521 198 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR5AC1P0C628 307 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CTSSP25774 331 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 PPP1CBP62140 327 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR5AC2Q9NZP5 309 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 RHBDL1O75783 438 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 AANATQ16613 207 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TFAP2EQ6VUC0 442 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LIAT1Q6ZQX7 453 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 DPPA2Q7Z7J5 298 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR4X2Q8NGF9 303 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR6K3Q8NGY3 331 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 VPS25Q9BRG1 176 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MS4A5Q9H3V2 200 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 FAM58AQ8N1B3 248 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR4C13Q8NGP0 309 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 PLAUP00749 431 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ADIRFQ15847 76 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ZNF528Q3MIS6 628 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 BAP18Q8IXM2 172 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SLC25A40Q8TBP6 338 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LRRC29Q8WV35 223 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 ARV1Q9H2C2 271 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CCL28Q9NRJ3 127 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SPRR3Q9UBC9 169 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 GPR137BO60478 399 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 EGR1P18146 543 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TPPP2P59282 170 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LCN2P80188 198 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 EBLN2Q6P2I7 272 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TNFSF18Q9UNG2 199 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 RNF115Q9Y4L5 304 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 DENND4AQ7Z401 1863 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 CGB3P0DN86 165 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 MOGAT3Q86VF5 341 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM147Q9BVK8 224 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 SLC2A9Q9NRM0 540 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR2F2O95006 317 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 IAPPP10997 89 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 UBA52P62987 128 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR2F1Q13607 317 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 LGI3Q8N145 548 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 OR1K1Q8NGR3 316 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 TMEM45BQ96B21 275 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 GALMQ96C23 342 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD2-201ENST00000249700 C2orf50Q96LR7 162 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms