RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630224.2

TCF4-269, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 501 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-269	ENST00000630224	PLPPR1	Q8TBJ4	325 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	CHPT1	Q8WUD6	406 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	CCDC107	Q8WV48	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	SNAPC3	Q92966	411 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	C8orf49	Q96NF6	230 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224		Q9N2K0	584 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	EHF	Q9NZC4	300 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	MIOX	Q9UGB7	285 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	KIF25	Q9UIL4	384 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		5.09	□□□□□ -1.59
TCF4-269	ENST00000630224		A0A1W2PPH5	198 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	hADV38S2	A0JD32	116 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	NDUFS8	O00217	210 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	HSPA12A	O43301	675 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TFF1	P04155	84 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR5H8	P0DN80	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GZMH	P20718	246 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GIF	P27352	417 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SLC6A1	P30531	599 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	IL2RG	P31785	369 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GLIPR1	P48060	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RFX2	P48378	723 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SEC61A1	P61619	476 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	HLA-DRB3	P79483	266 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OXA1L	Q15070	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	MIDN	Q504T8	468 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	ZNF880	Q6PDB4	577 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	NRARP	Q7Z6K4	114 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR56B4	Q8NH76	319 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	COQ2	Q96H96	371 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	AJUBA	Q96IF1	538 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SCGB3A2	Q96PL1	93 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR8B2	Q96RD0	313 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GINS4	Q9BRT9	223 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OPN4	Q9UHM6	478 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	NUBP2	Q9Y5Y2	271 aa		5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	FAM172BP	A6NC97	362 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	VWC2L	B2RUY7	222 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	C12orf77	C9JDV5	145 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	DVL1	O14640	695 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	BET1	O15155	118 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	DIRAS3	O95661	229 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TCRB	P04435	133 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GSTT2	P0CG29	244 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SELL	P14151	372 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	NPY4R	P50391	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	CCR6	P51684	374 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	HERV-K104	P61576	105 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	HMGN3	Q15651	99 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	PLA1A	Q53H76	456 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	ESCO2	Q56NI9	601 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	FAAP20	Q6NZ36	180 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	CCBE1	Q6UXH8	406 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	IDO2	Q6ZQW0	420 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	PRR18	Q8N4B5	295 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	DUSP18	Q8NEJ0	188 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	OR10J5	Q8NHC4	309 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	TERB2	Q8NHR7	220 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	MRGPRD	Q8TDS7	321 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	ARL11	Q969Q4	196 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GALM	Q96C23	342 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	RAB39B	Q96DA2	213 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SLC6A7	Q99884	636 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCF4-269	ENST00000630224	SLC2A8	Q9NY64	477 aa		5.07	□□□□□ -1.6

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