RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607561.1

RNU6-87P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 87, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-87P, Length 108 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-87P-201ENST00000607561 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RORBQ92753 470 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SERPINB11Q96P15 392 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 HBEGFQ99075 208 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACBD6Q9BR61 282 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q9BRP9 147 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 GTSF1LQ9H1H1 148 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPACA1Q9HBV2 294 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 DMAC2Q9NW81 257 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ENPP5Q9UJA9 477 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SCML1Q9UN30 329 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 DSCAMO60469 2012 aa1.01□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 KDM5BQ9UGL1 1544 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MKRN2OSH3BPM6 223 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SNAP29O95721 258 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 GP1BAP07359 652 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC35E2BP0CK96 405 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 NQO2P16083 231 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CD36P16671 472 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATF1P18846 271 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 GADD45AP24522 165 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ACTR1BP42025 376 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 AKR1C2P52895 323 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAB31Q13636 194 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 FLOT2Q14254 428 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MAPK14Q16539 360 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TIMM23BQ5SRD1 257 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q6ZSA8 131 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SYCE1Q8N0S2 351 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR11H1Q8NG94 326 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR10A6Q8NH74 314 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 C16orf78Q8WTQ4 265 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 GPR22Q99680 433 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF426Q9BUY5 554 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 C11orf1Q9H5F2 150 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 NRBP2Q9NSY0 501 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 FBXL3Q9UKT7 428 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 NUMA1Q14980 2115 aa1□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RGS12O14924 1447 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 COL6A6A6NMZ7 2263 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ERICH2A1L162 156 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 EFCAB9A8MZ26 197 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 H3BSA7 217 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RCVRNP35243 200 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SULT1A2P50226 295 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC35A2P78381 396 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR4D1Q15615 310 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RASL11AQ6T310 242 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CCDC121Q6ZUS5 278 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 DOLPP1Q86YN1 238 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 OR4X1Q8NH49 305 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TBX5Q99593 518 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 BBS2Q9BXC9 721 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MS4A12Q9NXJ0 267 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHMP5Q9NZZ3 219 aa0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 WDR90Q96KV7 1748 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SIGLEC16A6NMB1 481 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ESDP10768 282 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SLC25A16P16260 332 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ALOX5APP20292 161 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PSMB6P28072 239 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SYCP1Q15431 976 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CENPWQ5EE01 88 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 SPATA24Q86W54 205 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZNF563Q8TA94 476 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TAMM41Q96BW9 452 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MBOAT7Q96N66 472 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CYTH2Q99418 400 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 MED18Q9BUE0 208 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 PECRQ9BY49 303 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CHST5Q9GZS9 411 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 CD300AQ9UGN4 299 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 FIS1Q9Y3D6 152 aa0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP0.98□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 RAD50Q92878 1312 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 DHRS12A0PJE2 317 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TMEM213A2RRL7 107 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 LINC00862A6NCI5 91 aa0.97□□□□□ -2.25
RNU6-87P-201ENST00000607561 TRPC5OSA6NMA1 111 aa0.97□□□□□ -2.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.6 ms