RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PDCD1Q15116 288 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ZNF585BQ52M93 769 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PLCXD3Q63HM9 321 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 C7orf61Q8IZ16 206 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 Q8N976 141 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CPT1CQ8TCG5 803 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TBX15Q96SF7 602 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CACNG5Q9UF02 275 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SERPINA7P05543 415 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CYC1P08574 325 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 FOXL2P58012 376 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PPP1CBP62140 327 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 MS4A10Q96PG2 267 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR51B6Q9H340 312 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SH2D2AQ9NP31 389 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SZT2Q5T011 3432 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 LINC01565O15544 149 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ZFAND5O76080 213 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CTRLP40313 264 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR1D5P58170 312 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SLC38A11Q08AI6 406 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PLXDC1Q8IUK5 500 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 Q8N7P7 452 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 GATAD1Q8WUU5 269 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR2H1Q9GZK4 316 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR2J1Q9GZK6 312 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 IL17BQ9UHF5 180 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 XIRP2A4UGR9 3374 aa8.39□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 NPIPA3F8WFD2 350 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 DEGS1O15121 323 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ADMP35318 185 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PSG4Q00888 419 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 RAB1CQ92928 201 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ZFP30Q9Y2G7 519 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PDE6DO43924 150 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CA3P07451 260 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 UCN2Q96RP3 112 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 PROK2Q9HC23 129 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 MSL2Q9HCI7 577 aa8.38□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TNFSF12O43508 249 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 IAPPP10997 89 aa8.37□□□□□ -1.07
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HCG18-242ENST00000602319 ZNF32P17041 273 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 S100GP29377 79 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 WNT5AP41221 380 aa8.37□□□□□ -1.07
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HCG18-242ENST00000602319 Q0VG73 95 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TMEM183BQ1AE95 376 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 NUFIP2Q7Z417 695 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR4F5Q8NH21 305 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CMTM2Q8TAZ6 248 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CLDN23Q96B33 292 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 OR4F4Q96R69 305 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TMEM147Q9BVK8 224 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TMEM9BQ9NQ34 198 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ZIC3O60481 467 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 NTF4P34130 210 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 GNB1P62873 340 aa8.37□□□□□ -1.07
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HCG18-242ENST00000602319 FAM78BQ5VT40 261 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 FAM69BQ5VUD6 431 aa8.37□□□□□ -1.07
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HCG18-242ENST00000602319 KCNIP2Q9NS61 270 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GUS0 222 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 CD300LBA8K4G0 201 aa8.37□□□□□ -1.07
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HCG18-242ENST00000602319 DUX1O43812 170 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SYNGR4O95473 234 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SERPINE2P07093 398 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 LIFP15018 202 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TPPP2P59282 170 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 DEFB133Q30KQ1 61 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 NRN1LQ496H8 165 aa8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ZNF716A6NP11 495 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 F6UZH7 168 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 TDGF1P13385 188 aa8.36□□□□□ -1.07
HCG18-242ENST00000602319 ARL4DP49703 201 aa8.36□□□□□ -1.07
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