RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590211.5

CAPNS1-210, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5

Gene CAPNS1, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-210ENST00000590211 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DRAM2Q6UX65 266 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 IDO2Q6ZQW0 420 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 AAED1Q7RTV5 226 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BIVMQ86UB2 503 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR5AS1Q8N127 324 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LRRC18Q8N456 261 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST4Q8NCG5 386 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNRF1Q8ND25 227 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2M7Q8NG81 312 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR51S1Q8NGJ8 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR2T35Q8NGX2 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10R2Q8NGX6 335 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR8S1Q8NH09 359 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10D3Q8NH80 312 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 LILRB4Q8NHJ6 448 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ASB13Q8WXK3 278 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 AQP3Q92482 292 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NABP1Q96AH0 204 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SEH1LQ96EE3 360 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF799Q96GE5 643 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RCHY1Q96PM5 261 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 S100A13Q99584 98 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PRRT1Q99946 306 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CITED1Q99966 193 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SEC22CQ9BRL7 303 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CHST5Q9GZS9 411 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 CST11Q9H112 138 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC2A8Q9NY64 477 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MGAT4AQ9UM21 535 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 V9GYS6 101 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.41□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 MYO18BQ8IUG5 2567 aa3.4□□□□□ -1.86
CAPNS1-210ENST00000590211 A0A087WW49 117 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C6A6NF89 314 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TMEM235A6NFC5 223 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 DHRS7CA6NNS2 312 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 F5H5P2 479 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 M0R233 179 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 WRBO00258 174 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 GOSR2O14653 212 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NXPH4O95158 308 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CA1P00915 261 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 IFNA6P05013 189 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HPNP05981 417 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR4E1P0C645 316 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF806P0C7X5 589 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 STAG3L3P0CL85 134 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ZNF32P17041 273 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CD82P27701 267 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HTR2BP41595 481 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CBX5P45973 191 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR3A4PP47883 348 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 TAS2R31P59538 309 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ERVK-16P61578 105 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 QRFPP83859 136 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 PLGLB1Q02325 96 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MPPED2Q15777 294 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 STK11Q15831 433 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ECSCRQ19T08 205 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CEACAM16Q2WEN9 425 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SNAI3Q3KNW1 292 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MOGAT2Q3SYC2 334 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 CDNFQ49AH0 187 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 C6orf226Q5I0X4 101 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 HES3Q5TGS1 186 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 OR10K2Q6IF99 312 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 LPCAT3Q6P1A2 487 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 Q6ZRP5 223 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 MOB3BQ86TA1 216 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 ALPK2Q86TB3 2170 aa3.4□□□□□ -1.87
CAPNS1-210ENST00000590211 NAA40Q86UY6 237 aa3.4□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.9 ms