RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 STARD5Q9NSY2 213 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ASF1BQ9NVP2 202 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TAS2R8Q9NYW2 309 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF319Q9P2F9 582 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 Q9UF83 564 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KLF12Q9Y4X4 402 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NOTCH4Q99466 2003 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa2.54□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IQGAP1P46940 1657 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NWD1Q149M9 1564 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ATRNO75882 1429 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GTH9 108 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GV50 99 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1B0GW64 132 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 MSGN1A6NI15 193 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 H0YIZ8 118 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF354AO60765 605 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 REG1AP05451 166 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DQB2P05538 268 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR5AL1P0C617 328 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 OR5AP2Q8NGF4 316 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR51A4Q8NGJ6 313 aa2.53□□□□□ -2
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PTPRM-204ENST00000577468 KCNIP1Q9NZI2 227 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MDFICQ9P1T7 246 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GAGE2DQ9UEU5 116 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 VAX2Q9UIW0 290 aa2.53□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SCML2Q9UQR0 700 aa2.53□□□□□ -2
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