RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 PITPNC1Q9UKF7 332 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 VSIG10L2P0DP72 767 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BRS3P32247 399 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RPS19P39019 145 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LSM3P62310 102 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 LY6G6FQ5SQ64 297 aa15.98■□□□□ 0.15
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RABGGTA-210ENST00000559586 Q6ZS46 218 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 DRAM1Q8N682 238 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 GALMQ96C23 342 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC25A38Q96DW6 304 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF702PQ9H963 129 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 METTL21EPA6NDL7 271 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HSD17B6O14756 317 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 YPEL1O60688 119 aa15.97■□□□□ 0.15
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RABGGTA-210ENST00000559586 RAB7AP51149 207 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 HLA-DRB3P79483 266 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 OR8H3Q8N146 312 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 Q8N2B8 174 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 OR56B4Q8NH76 319 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SETD6Q8TBK2 473 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 YPEL2Q96QA6 119 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ATG5Q9H1Y0 275 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 PLXNB1O43157 2135 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa15.96■□□□□ 0.15
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RABGGTA-210ENST00000559586 AMY2AP04746 511 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SCTP09683 121 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 MNDAP41218 407 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 SCAND1P57086 179 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 BLCAPP62952 87 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 IDNKQ5T6J7 187 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 THNSL2Q86YJ6 484 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 OR4F17Q8NGA8 305 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 OR4F4Q96R69 305 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 RHBDL2Q9NX52 303 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 ABRACLQ9P1F3 81 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 NOTCH3Q9UM47 2321 aa15.96■□□□□ 0.15
RABGGTA-210ENST00000559586 A0A075B6Q4 140 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 FBXO24O75426 580 aa15.95■□□□□ 0.14
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RABGGTA-210ENST00000559586 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
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RABGGTA-210ENST00000559586 IL1F10Q8WWZ1 152 aa15.95■□□□□ 0.14
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RABGGTA-210ENST00000559586 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.95■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SERPINE3A8MV23 424 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 OR2F2O95006 317 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CD3GP09693 182 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 EBI3Q14213 229 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CDNFQ49AH0 187 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 C16orf82Q7Z2V1 217 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NDUFA11Q86Y39 141 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CAPSLQ8WWF8 208 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SLC25A33Q9BSK2 321 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IFI27L2Q9H2X8 130 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SERTAD4Q9NUC0 356 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MGAT4AQ9UM21 535 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ETV7Q9Y603 341 aa15.94■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TRDCB7Z8K6 153 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PEX14O75381 377 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IL3RAP26951 378 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 Q8N6K4 173 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 AGMATQ9BSE5 352 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 PRSS22Q9GZN4 317 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 SPATA2Q9UM82 520 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 LANCL1O43813 399 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM127O75204 238 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 RGS11O94810 467 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM106CPP0CH98 169 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 VBP1P61758 197 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 CTF1Q16619 201 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF260Q3ZCT1 412 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 MOB3BQ86TA1 216 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGGTA-210ENST00000559586 IZUMO1Q8IYV9 350 aa15.92■□□□□ 0.14
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