RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558666.1

TMOD3-204, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 465 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-204ENST00000558666 SSMEM1Q8WWF3 244 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IL1F10Q8WWZ1 152 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TOMM40LQ969M1 308 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C10orf35Q96D05 121 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GFI1Q99684 422 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ELOVL1Q9BW60 279 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM133Q9H2Q1 129 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ABCB10Q9NRK6 738 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C1RLQ9NZP8 487 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SESN1Q9Y6P5 492 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ANK2Q01484 3957 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 DNHD1Q96M86 4753 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 A0A0A6YYD4 124 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PPE2 198 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PR64 198 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 A0A1W2PRV1 198 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C17orf98A8MV24 154 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ODF3BA8MYP8 253 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 J3QRK9 145 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TOR1AO14656 332 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 FSTL3O95633 263 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MYL9P24844 172 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HSPA13P48723 471 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 UBE2E1P51965 193 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 UNC119Q13432 240 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IRF3Q14653 427 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF146Q15072 292 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RAB11BQ15907 218 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C17orf58Q2M2W7 97 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C16orf87Q6PH81 154 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C16orf54Q6UWD8 224 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C9orf139Q6ZV77 190 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 USP43Q70EL4 1123 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF367Q7RTV3 350 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C11orf42Q8N5U0 333 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 KLHDC1Q8N7A1 406 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 NKAIN3Q8N8D7 197 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CCDC54Q8NEL0 328 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR51D1Q8NGF3 324 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR4P4Q8NGL7 312 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR4C13Q8NGP0 309 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR10X1Q8NGY0 326 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CAPSLQ8WWF8 208 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ARL11Q969Q4 196 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MGLLQ99685 303 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SULT4A1Q9BR01 284 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CENPOQ9BU64 300 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM59Q9BXS4 323 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 OR51E2Q9H255 320 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 DPAGT1Q9H3H5 408 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 Q9H521 79 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ACOT13Q9NPJ3 140 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GNG12Q9UBI6 72 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 RAB26Q9ULW5 256 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PEX16Q9Y5Y5 336 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TMEM89A2RUT3 159 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 C12orf77C9JDV5 145 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 MCRIP1C9JLW8 97 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 PRYO14603 147 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HSD17B6O14756 317 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 TIMM23O14925 209 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 SOCS1O15524 211 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 IL1AP01583 271 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HBZP02008 142 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 CD3GP09693 182 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GTF2F2P13984 249 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GADD45AP24522 165 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HTR1DP28221 377 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 HTR2CP28335 458 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-204ENST00000558666 GABRA5P31644 462 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.3 ms