RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	HTD2	P86397	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DHODH	Q02127	395 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BAMBI	Q13145	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DHRS2	Q13268	280 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FCN2	Q15485	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM155	Q4W5P6	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C11orf71	Q6IPW1	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR8B3	Q8NGG8	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR1L1	Q8NH94	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	COQ2	Q96H96	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C8orf49	Q96NF6	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR8B2	Q96RD0	313 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NEURL2	Q9BR09	285 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM246	Q9BRR3	403 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SUCNR1	Q9BXA5	334 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C5orf66	Q9H5L9	145 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CHODL	Q9H9P2	273 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	JPT1	Q9UK76	154 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LAMA5	O15230	3695 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ATM	Q13315	3056 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.61	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0B4J293	547 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C3orf85	A0A1B0GTC6	90 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A1L4Q6	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C5orf51	A6NDU8	294 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067		A8MV72	311 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	DVL1	O14640	695 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PHF1	O43189	567 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TUSC2	O75896	110 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ATG12	O94817	140 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HEXA	P06865	529 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	SERPINE2	P07093	398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR8U9	P0C7N5	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LYNX1	P0DP58	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	C4BPB	P20851	252 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NFYB	P25208	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GPR12	P47775	334 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PDLIM4	P50479	330 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RAB7A	P51149	207 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RAP2B	P61225	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RND3	P61587	244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FGL1	Q08830	312 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CATR1	Q13166	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ICAM4	Q14773	271 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LTC4S	Q16873	150 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	AVPI1	Q5T686	147 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CLEC18B	Q6UXF7	455 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	GSG1L	Q6UXU4	331 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF695	Q8IW36	515 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	TCTE3	Q8IZS6	198 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	LGI3	Q8N145	548 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR52B4	Q8NGK2	314 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	OR8U1	Q8NH10	309 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RNASE11	Q8TAA1	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RFESD	Q8TAC1	157 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CORO2A	Q92828	525 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NEIL1	Q96FI4	390 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	CHIA	Q9BZP6	476 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATL1-208	ENST00000556067	NAA60	Q9H7X0	242 aa		4.6	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms