RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 KISS1Q15726 138 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SP6Q3SY56 376 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 Q6ZS49 121 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 Q6ZWC4 215 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SIGMAR1Q99720 223 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 RSG1Q9BU20 258 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM160Q9NX00 188 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MLNRO43193 412 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGHG3P01860 377 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CEACAM5P06731 702 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 BATFQ16520 125 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC10Q5BKY1 277 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 BOD1L2Q8IYS8 172 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C16orf52Q8NHV5 167 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DOK4Q8TEW6 326 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GCM1Q9NP62 436 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LOC101059948A0A1B0GTJ6 334 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SSSCA1O60232 199 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF205O95201 554 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGLV3-1P01715 115 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGLC2P0DOY2 106 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGLC3P0DOY3 106 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CTSEP14091 401 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HBG1P69891 147 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HBG2P69892 147 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM177Q53S58 311 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C17orf99Q6UX52 265 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SPATA25Q9BR10 227 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PPIAL4AQ9Y536 164 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LRRC3CA6NJW4 275 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CCR2P41597 374 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 NMSQ5H8A3 153 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 RNFT1Q5M7Z0 435 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CADM4Q8NFZ8 388 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 FOXQ1Q9C009 403 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PARLQ9H300 379 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM74BQ9NUR3 256 aa7.56□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMED7-TICAM2A0A0A6YYA0 188 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 FRG2CA6NGY1 282 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TOX4O94842 621 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ADOQ96SZ5 270 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 SLC39A9Q9NUM3 307 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CCL26Q9Y258 94 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GAGE12BA1L429 117 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM189A5PLL7 270 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HCRTR1O43613 425 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 GNG7O60262 68 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PSG1P11464 419 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ADH5P11766 374 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 FMODQ06828 376 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF726P1Q15940 193 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PMCHL1Q16048 86 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM256Q8N2U0 113 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR8B12Q8NGG6 310 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR5P3Q8WZ94 311 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LHX4Q969G2 390 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ELSPBP1Q96BH3 223 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 OR6C1Q96RD1 312 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TRIB1Q96RU8 372 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 APOOQ9BUR5 198 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DOCK3Q8IZD9 2030 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 A0A1W2PRS3 328 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LRP5LA4QPB2 252 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C19orf67A6NJJ6 358 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 MPZL1O95297 269 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 NTSR1P30989 418 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ARG2P78540 354 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF154Q13106 437 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 CST9LP1Q5W188 147 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 KIAA0895LQ68EN5 471 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 UFSP1Q6NVU6 142 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 LCN15Q6UWW0 184 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DEFB132Q7Z7B7 95 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 HSPB9Q9BQS6 159 aa7.55□□□□□ -1.2
GPBP1-208ENST00000514387 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms