RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512131.5

SH3BP2-223, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-223	ENST00000512131	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	BEX1	Q9HBH7	125 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SPATA2	Q9UM82	520 aa		13.85	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD3G	P09693	182 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	VBP1	P61758	197 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	THNSL2	Q86YJ6	484 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SETD6	Q8TBK2	473 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	NAA50	Q9GZZ1	169 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
SH3BP2-223	ENST00000512131	HSD17B6	O14756	317 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TIMM23	O14925	209 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	RGS11	O94810	467 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	FCGR3A	P08637	254 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SCT	P09683	121 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	PPP1CC	P36873	323 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.83	□□□□□ -0.2	1e-7	■■■■□ 25
SH3BP2-223	ENST00000512131	CDNF	Q49AH0	187 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q6ZS49	121 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM219	Q86XT9	240 aa		13.83	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A075B6Q4	140 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		A0A0A6YYH2	397 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1-6	A0A0C4DH72	117 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		A6NJ64	397 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRDC	B7Z8K6	153 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ITGB1BP1	O14713	200 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GSTP1	P09211	210 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	CD24	P25063	80 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL3RA	P26951	378 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SERPINB10	P48595	397 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	HACD4	Q5VWC8	232 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	C16orf82	Q7Z2V1	217 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ODF3L1	Q8IXM7	274 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	KCTD12	Q96CX2	325 aa	Known RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	CITED1	Q99966	193 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABHD14A	Q9BUJ0	271 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ABCG5	Q9H222	651 aa		13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	LANCL1	O43813	399 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DIRAS3	O95661	229 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZBTB25	P24278	435 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	PROK1	P58294	105 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ARFRP1	Q13795	201 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	EBI3	Q14213	229 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GPR141	Q7Z602	305 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		Q8N2B8	174 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4A4P	Q8NGN8	299 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	AGMAT	Q9BSE5	352 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IFI27L2	Q9H2X8	130 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	MMP27	Q9H306	513 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	RNF114	Q9Y508	228 aa		13.81	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	FABP7	O15540	132 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TXNL1	O43396	289 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2F2	O95006	317 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DTYMK	P23919	212 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	REG1B	P48304	166 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	PITPNA	Q00169	270 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR2AK2	Q8NG84	335 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	PARP12	Q9H0J9	701 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	OR1A1	Q9P1Q5	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TMEM235	A6NFC5	223 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131		M0QZ24	198 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	FAM106CP	P0CH98	169 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	CEACAM6	P40199	344 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF833P	Q6ZTB9	187 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TGIF2LX	Q8IUE1	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IZUMO1	Q8IYV9	350 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	LYG1	Q8N1E2	194 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	GHITM	Q9H3K2	345 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.79	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		13.78	□□□□□ -0.2
SH3BP2-223	ENST00000512131	SSX5	O60225	188 aa		13.78	□□□□□ -0.2

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