RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502274.1

SH3TC2-202, Transcript of SH3 domain and tetratricopeptide repeats 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SH3TC2, Length 2,681 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3TC2-202ENST00000502274 TMEM144Q7Z5S9 345 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 PRR18Q8N4B5 295 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 WDYHV1Q96HA8 205 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 GPR35Q9HC97 309 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 CACNG5Q9UF02 275 aa11.91□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 PSG2P11465 335 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 TEX43Q6ZNM6 134 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 PIGCQ92535 297 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 OR6C6A6NF89 314 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 CD99P14209 185 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 CFHR1Q03591 330 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 PCSK4Q6UW60 755 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 SDSLQ96GA7 329 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 DIRC2Q96SL1 478 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 STRADBQ9C0K7 418 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 TMEM106BQ9NUM4 274 aa11.9□□□□□ -0.5
SH3TC2-202ENST00000502274 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 CD300LBA8K4G0 201 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 MLNRO43193 412 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IGKV1-39P01597 117 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IGKV1D-39P04432 117 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 GCH1P30793 250 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR1D5P58170 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 DEFB133Q30KQ1 61 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 BATF2Q8N1L9 274 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 LRFN3Q9BTN0 628 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 A0A0U1RQK1 487 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF320A2RRD8 509 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TLE1Q04724 770 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 FOXL1Q12952 345 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 FAM78BQ5VT40 261 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ACSM6Q6P461 480 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR51H1Q8NH63 302 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PARD6AQ9NPB6 346 aa11.89□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 A0A1B0GUS0 222 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZFAND5O76080 213 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SOX8P57073 446 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 RANP62826 216 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SLC38A11Q08AI6 406 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SYT13Q7L8C5 426 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 GATAD1Q8WUU5 269 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 UCN2Q96RP3 112 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 FGF21Q9NSA1 209 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR2W1Q9Y3N9 320 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 UNC13CQ8NB66 2214 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ASXL3Q9C0F0 2248 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 CHRNA7P36544 502 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PPP1CBP62140 327 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PAFAH1B2P68402 229 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PLXDC1Q8IUK5 500 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR2J1Q9GZK6 312 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SLC25A22Q9H936 323 aa11.88□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 DKK1O94907 266 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SELEP16581 610 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 BCL3P20749 454 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SPANXN5Q5MJ07 72 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 CST9LP1Q5W188 147 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TOMM20LQ6UXN7 152 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 IGKV1-5P01602 117 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 UMODP07911 640 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 ZNF32P17041 273 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 NPPCP23582 126 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TNFSF10P50591 281 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 FGF12P61328 243 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TDRG1Q3Y452 100 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 CMTM2Q8TAZ6 248 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 WNT16Q9UBV4 365 aa11.87□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TNFSF11O14788 317 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PLA2G5P39877 138 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 Q6ZWC4 215 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 LINC01551Q86U37 167 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR10V1Q8NGI7 309 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR10G9Q8NGN4 311 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 OR10G7Q8NGN6 311 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PCED1AQ9H1Q7 454 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 PLA2G3Q9NZ20 509 aa11.86□□□□□ -0.51
SH3TC2-202ENST00000502274 LRP5LA4QPB2 252 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms