RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 AMBNQ9NP70 447 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GPR84Q9NQS5 396 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 UFSP2Q9NUQ7 469 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ACOXLQ9NUZ1 547 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM100Q9NV29 134 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLN6Q9NWW5 311 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 V9GYS6 101 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ATRQ13535 2644 aa3.36□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 COL6A5A8TX70 2615 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPIAL4EA0A075B759 164 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PQLC2LA1A4F0 135 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GGT3PA6NGU5 568 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 A6NIN4 97 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF850A8MQ14 1090 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 B4DSR2 109 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPIAL4DF5H284 164 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 H3BSH0 61 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GMDSO60547 372 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 FSTL3O95633 263 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 CST4P01036 141 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNAO1P09471 354 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LIMS3P0CW19 117 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LIMS4P0CW20 117 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPIAL4FP0DN26 164 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 DBTP11182 482 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ADRA2CP18825 462 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 HSD11B1P28845 292 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR12D2P58182 307 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LCN2P80188 198 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR8G1Q15617 311 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 MOGQ16653 247 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRRC36Q1X8D7 754 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMUG1Q53HV7 270 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF691Q5VV52 312 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LIPNQ5VXI9 398 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 CALHM1Q8IU99 346 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GID4Q8IVV7 300 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM216BQ8N7L0 139 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF540Q8NDQ6 660 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR52H1Q8NGJ2 320 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR52I1Q8NGK6 324 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 C8orf46Q8TAG6 207 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51E1Q8TCB6 317 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPS4Y2Q8TD47 263 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 VN1R17PQ8TDU5 208 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR5P3Q8WZ94 311 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB1CQ92928 201 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TMEM186Q96B77 213 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GAL3ST1Q99999 423 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 VCXQ9H320 206 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 NIPAL2Q9H841 368 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ESM1Q9NQ30 184 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 FKBP14Q9NWM8 211 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 C1orf123Q9NWV4 160 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 UBAP1Q9NZ09 502 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF222Q9UK12 451 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 IKZF2Q9UKS7 526 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PRELID1Q9Y255 219 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPIAL4AQ9Y536 164 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LRRC42Q9Y546 428 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 GMPPBQ9Y5P6 360 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 INSIG2Q9Y5U4 225 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 R4GMQ9 66 aa3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ISPDA4D126 451 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 METTL15A6NJ78 407 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 LGALS8O00214 317 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDIPTO14735 213 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 AKR7A2O43488 359 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SYNGR1O43759 233 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF254O75437 659 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 SULT1C4O75897 302 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 DHRS3O75911 302 aa3.34□□□□□ -1.87
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPP14O95059 124 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.9 ms