RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 GLI4P10075 376 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ANOS1P23352 680 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RANP62826 216 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 GNB2P62879 340 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HSPB2Q16082 182 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CBLN3Q6UW01 205 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LRRC75AQ8NAA5 344 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR5L1Q8NGL2 311 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF519Q8TB69 540 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TMEM170AQ8WVE7 144 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SARAFQ96BY9 339 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 DOCK7Q96N67 2140 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ALG12Q9BV10 488 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 A0A1B0GV50 99 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FIGNL2A6NMB9 653 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF716A6NP11 495 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 G3V3Y1 287 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 J3QKU1 62 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 BGLAPP02818 100 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TMEM225Q6GV28 225 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CDC20BQ86Y33 519 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 C4orf45Q96LM5 186 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RBKSQ9H477 322 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ARPC3O15145 178 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PSG1P11464 419 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PGCP20142 388 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 COX5AP20674 150 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CEBPGP53567 150 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PMP22Q01453 160 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TAF9Q16594 264 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 VAX1Q5SQQ9 334 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FGGYQ96C11 551 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 GJE1A6NN92 205 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 H3BSH0 61 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NUPR1O60356 82 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ASAH2BP0C7U1 165 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PNMTP11086 282 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 FSTP19883 344 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 GPR157Q5UAW9 335 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SSX8Q7RTT4 187 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 SGPP2Q8IWX5 399 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PRR22Q8IZ63 422 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TBX15Q96SF7 602 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 E5RGE8 158 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 GPR137BO60478 399 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PRB1P04280 392 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CD33P20138 364 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CTRLP40313 264 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HIST1H3AP68431 136 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NRN1LQ496H8 165 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 WDR38Q5JTN6 314 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF66Q6ZN08 573 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TECTBQ96PL2 329 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 NSG2Q9Y328 171 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LIPT2A6NK58 231 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 AQP7P3A6NL99 342 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 C1orf100Q5SVJ3 147 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HIPK2Q9H2X6 1198 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 HSF4Q9ULV5 492 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.54□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 LIPFP07098 398 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PFN1P07737 140 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CTSSP25774 331 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 TAS2R30P59541 319 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 PLXDC2Q6UX71 529 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 C11orf40Q8WZ69 217 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CKLFQ9UBR5 152 aa6.53□□□□□ -1.36
USP4-211ENST00000485450 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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