RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485002.6

MEGF6-205, Transcript of multiple EGF like domains 6, human

TSL 5

Gene MEGF6, Length 4,705 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MEGF6-205	ENST00000485002	LIF	P15018	202 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	RAB7A	P51149	207 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	IGLV3-21	P80748	117 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ZBTB34	Q8NCN2	500 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	OR4S2	Q8NH73	311 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRC29	Q8WV35	223 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002		A0A0J9YW62	118 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CXorf1	O96002	111 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CHRNB4	P30926	498 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CYB5R2	Q6BCY4	276 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	COA4	Q9NYJ1	87 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TIMM9	Q9Y5J7	89 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CHD5	Q8TDI0	1954 aa		13.61	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	DNPH1	O43598	174 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	SPRY3	O43610	288 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	NHLH1	Q02575	133 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	SELENOH	Q8IZQ5	122 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CISD1	Q9NZ45	108 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	HTR1D	P28221	377 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	PSG4	Q00888	419 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	RNF122	Q9H9V4	155 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	EP300	Q09472	2414 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ST8SIA5	O15466	376 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	HAND1	O96004	215 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	FGF12	P61328	243 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	PRSS3P2	Q8NHM4	247 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	GPR146	Q96CH1	333 aa		13.6	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BRS3	P32247	399 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	KIR2DS2	P43631	304 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TEX50	A0A1B0GTY4	177 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	MPL	P40238	635 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	SPSB2	Q99619	263 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ZDHHC8	Q9ULC8	765 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TDRD6	O60522	2096 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BMPR1B	O00238	502 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	TRA2A	Q13595	282 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23	3e-8	■■■■■ 37.6
MEGF6-205	ENST00000485002	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BLNK	Q8WV28	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ATP23	Q9Y6H3	246 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002		H0YIZ8	118 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	PGLYRP1	O75594	196 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	LYPD3	O95274	346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	IGHM	P01871	453 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ARL16	Q0P5N6	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF506	Q5JVG8	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CHCHD2P9	Q5T1J5	151 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002		F8VVB4	439 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002		F8VWA3	439 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	LYZL6	O75951	148 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	CD99	P14209	185 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	DOCK6	Q96HP0	2047 aa		13.58	□□□□□ -0.23
MEGF6-205	ENST00000485002	C5orf52	A6NGY3	159 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	COLCA2	A8K830	154 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	OR5AL1	P0C617	328 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	CD1B	P29016	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	VMA21	Q3ZAQ7	101 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	RBKS	Q9H477	322 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	SIAH2	O43255	324 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	UCP3	P55916	312 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	TINAG	Q9UJW2	476 aa		13.58	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	LGALS4	P56470	323 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	ZADH2	Q8N4Q0	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	TP53RK	Q96S44	253 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	RPRM	Q9NS64	109 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	CSN3	P07498	182 aa		13.57	□□□□□ -0.24
MEGF6-205	ENST00000485002	ZNF735	P0CB33	412 aa		13.57	□□□□□ -0.24

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