RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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RABGEF1-207ENST00000484547 C9orf170A2RU37 121 aa9.55□□□□□ -0.88
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RABGEF1-207ENST00000484547 BAP18Q8IXM2 172 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OR5AP2Q8NGF4 316 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 C8orf46Q8TAG6 207 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 SCGB3A2Q96PL1 93 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CHST6Q9GZX3 395 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 OPA3Q9H6K4 179 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 CENPMQ9NSP4 180 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF391Q9UJN7 358 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.54□□□□□ -0.88
RABGEF1-207ENST00000484547 FAM74A7A6NL05 159 aa9.54□□□□□ -0.88
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