RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478954.1

STRADBP1-201, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene STRADBP1, Length 1,281 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADBP1-201ENST00000478954 RPL31P62899 125 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C2orf80Q0P641 193 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PIGGQ5H8A4 983 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 FAHD1Q6P587 224 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 DCUN1D2Q6PH85 259 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF786Q8N393 782 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C11orf72Q8NBR9 251 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CHST4Q8NCG5 386 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 NPBQ8NG41 125 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB2BQ8WUD1 216 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 LRRC29Q8WV35 223 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 RASSF5Q8WWW0 418 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 NTAN1Q96AB6 310 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM101Q96IK0 257 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ZNF75AQ96N20 296 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C9orf16Q9BUW7 83 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 MROQ9BYG7 248 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 OR2S2Q9NQN1 319 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C14orf105Q9NVL8 296 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.92□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 A0A1W2PP18 115 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SYCE1LA8MT33 242 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 EVPLLA8MZ36 301 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC22A1O15245 554 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PLIN3O60664 434 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CST8O60676 142 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SCN2BO60939 215 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CBR3O75828 277 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 GCGP01275 180 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 APOC2P02655 101 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 TFPTP0C1Z6 253 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM10L1P0DMW3 83 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 MAGP20916 626 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 GNRHRP30968 328 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 UGT2B10P36537 528 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PRLHRP49683 370 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CAV2P51636 162 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 HCCSP53701 268 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 KRTAP10-3P60369 221 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 STX5Q13190 355 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PMS2P3Q13401 168 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 DGCR6Q14129 220 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SPCS2Q15005 226 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 KCNJ8Q15842 424 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 RFX4Q33E94 735 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CPTPQ5TA50 214 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 NANOGP8Q6NSW7 305 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 EPGNQ6UW88 154 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 AKAP14Q86UN6 197 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 GPR26Q8NDV2 337 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 ACTL9Q8TC94 416 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SMIM10Q96HG1 83 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 SFXN3Q9BWM7 321 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 CES1P1Q9UKY3 287 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 PRELID1Q9Y255 219 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 RNF11Q9Y3C5 154 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 KLF12Q9Y4X4 402 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 OR51B2Q9Y5P1 312 aa3.91□□□□□ -1.78
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ISPDA4D126 451 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FAM159BA6NKW6 160 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 J3QRK9 145 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DFFAO00273 331 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 XKRYO14609 159 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 HDAC3O15379 428 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LY6HO94772 140 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 RAB3DO95716 219 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 BGLAPP02818 100 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 GABRR1P24046 479 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 PFN2P35080 140 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 DYNLT1P63172 113 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLAMF1Q13291 335 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 LCE1EQ5T753 118 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 FBXW12Q6X9E4 464 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 Q6ZVH6 145 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 P2RY8Q86VZ1 359 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.9□□□□□ -1.79
STRADBP1-201ENST00000478954 TMEM35BQ8NCS4 154 aa3.9□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms