RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 AKR1E2Q96JD6 320 aa16.02■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 NGBQ9NPG2 151 aa16.02■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 NDRG3Q9UGV2 375 aa16.02■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CCL21O00585 134 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 WNT9BO14905 357 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 HEXAP06865 529 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CTRB1P17538 263 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LMO1P25800 156 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 BAXQ07812 192 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SMIM21Q3B7S5 101 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CTRB2Q6GPI1 263 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 PRR7Q8TB68 274 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CACFD1Q9UGQ2 172 aa16.01■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FAM157AC9JC47 383 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 HSD17B6O14756 317 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CHRNB4P30926 498 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CFHR2P36980 270 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 NHLH2Q02577 135 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 BSPH1Q075Z2 132 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ZNF497Q6ZNH5 498 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 MEGF10Q96KG7 1140 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 OR14J1Q9UGF5 321 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ADAM20O43506 726 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TSPAN15O95858 294 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LRRC29Q8WV35 223 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 OR2V2Q96R30 315 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 WIPI2Q9Y4P8 454 aa16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GU03 582 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 IFNL4K9M1U5 179 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SNCAP37840 140 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 VAMP2P63027 116 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 PEA15Q15121 130 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TMEM231Q9H6L2 316 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FAM96BQ9Y3D0 163 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 KPTNQ9Y664 436 aa15.99■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 A0A1B0GW64 132 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 UMAD1C9J7I0 102 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SPRY3O43610 288 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SFTA3P0C7M3 94 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LY6DQ14210 128 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FAM90A1Q86YD7 464 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TMEM252Q8N6L7 170 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LFNGQ8NES3 379 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 AIFM2Q9BRQ8 373 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SRRM5B3KS81 715 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 OR8U9P0C7N5 309 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 GATA4P43694 442 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CAMLGP49069 296 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CLEC9AQ6UXN8 241 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 C5orf24Q7Z6I8 188 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 OR8U1Q8NH10 309 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SMDT1Q9H4I9 107 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 C19orf12Q9NSK7 152 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 PIEZO1Q92508 2521 aa15.98■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 IGSF23A1L1A6 192 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FAM24AA6NFZ4 105 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 HSPA12AO43301 675 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CD80P33681 288 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 IL19Q9UHD0 177 aa15.97■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TNFSF4P23510 183 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 MIDNQ504T8 468 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 RNASE6Q93091 150 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 SCRT1Q9BWW7 348 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 VSTM5A8MXK1 200 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 K7N7A8 449 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 PSPNO60542 156 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 IGHV1-46P01743 117 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 ADIPOQQ15848 244 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 MOGAT3Q86VF5 341 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.96■□□□□ 0.15
SYF2-204ENST00000476231 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 SERPINE2P07093 398 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 TESK1Q15569 626 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 SLC35E4Q6ICL7 350 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 FAM122AQ96E09 287 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 DIRC2Q96SL1 478 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 HIPK2Q9H2X6 1198 aa15.95■□□□□ 0.14
SYF2-204ENST00000476231 FAM90A27PA6NNH2 459 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms