RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470710.1

HDLBP-233, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-233ENST00000470710 A0A0A6YYJ9 748 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1B0GX30 115 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 M0R1W7 72 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 GPR31O00270 319 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ENSAO43768 121 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 FOXH1O75593 365 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 MMP23AO75900 390 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 OR4E1P0C645 316 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 PI3P19957 117 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 OMGP23515 440 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 GNRHRP30968 328 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 RAB7AP51149 207 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 BCAP31P51572 246 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 DHRS2Q13268 280 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 LTC4SQ16873 150 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ABCA11PQ4W5N1 156 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 C4orf46Q504U0 113 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 C11orf88Q6PI97 169 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 PRSS57Q6UWY2 283 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 LYG2Q86SG7 212 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 LDLRAD3Q86YD5 345 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 CADM3Q8N126 398 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 KIR3DL3Q8N743 410 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ZBTB34Q8NCN2 500 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 BVESQ8NE79 360 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 OR2AK2Q8NG84 335 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF431Q8TF32 576 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 CHAC2Q8WUX2 184 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 SECTM1Q8WVN6 248 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 TMEM230Q96A57 120 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 SEC22CQ9BRL7 303 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 BEX2Q9BXY8 128 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 OR51J1Q9H342 316 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 BEX1Q9HBH7 125 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 SLC2A9Q9NRM0 540 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 SESN1Q9Y6P5 492 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 HECTD1Q9ULT8 2610 aa7.15□□□□□ -1.26
HDLBP-233ENST00000470710 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1W2PPE2 198 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1W2PR64 198 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 A0A1W2PRV1 198 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 IGLV2-14P01704 120 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 OR8U9P0C7N5 309 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 TRAPPC2P0DI81 140 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 TRAPPC2BP0DI82 140 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV1-8P0DP01 117 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 AKR1C4P17516 323 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 NFYBP25208 207 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CD34P28906 385 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 S100GP29377 79 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 PIGPP57054 158 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 PAX2Q02962 417 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 PPP1R1AQ13522 171 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF626Q68DY1 528 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 MED13LQ71F56 2210 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 KCTD9Q7L273 389 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CMTM1Q8IZ96 169 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF645Q8N7E2 425 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 OR8U1Q8NH10 309 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ZNF596Q8TC21 504 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CREBBPQ92793 2442 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 GALNT14Q96FL9 552 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 AGMATQ9BSE5 352 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 IFI27L2Q9H2X8 130 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 PSG11Q9UQ72 335 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 GAB2Q9UQC2 676 aa7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 A0A096LNT2 108 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 C9orf170A2RU37 121 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 HMX3A6NHT5 357 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 HSD17B6O14756 317 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 MPPED1O15442 326 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 ST8SIA5O15466 376 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 B3GALNT1O75752 331 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 SFT2D2O95562 160 aa7.13□□□□□ -1.27
HDLBP-233ENST00000470710 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
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