RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 NSG2Q9Y328 171 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 NBASA2RRP1 2371 aa4.71□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 HCFC1P51610 2035 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 IGSF10Q6WRI0 2623 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OOEPA6NGQ2 149 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 F5H0A9 414 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 C16orf97H3BN30 126 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 FCN3O75636 299 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 HBZP02008 142 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 BMP5P22003 454 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 PTAFRP25105 342 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM33P57088 247 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 RAB14P61106 215 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 Q6ZRM9 215 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ITLN1Q8WWA0 313 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 EDARADDQ8WWZ3 215 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 GPR146Q96CH1 333 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MUCL1Q96DR8 90 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SMIM8Q96KF7 97 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR2V2Q96R30 315 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CITED4Q96RK1 184 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 SCRT1Q9BWW7 348 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 GCM1Q9NP62 436 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 ZFP57Q9NU63 452 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 IL19Q9UHD0 177 aa4.7□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 ITGB1BP1O14713 200 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 HSD17B6O14756 317 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MGST3O14880 152 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 SSTR5P35346 364 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 CA7P43166 264 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 S100A10P60903 97 aa4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 C10orf91Q5T1B1 145 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 UTF1Q5T230 341 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TRAT1Q6PIZ9 186 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM108Q6UXF1 575 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
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PTPRC-210ENST00000462363 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 OR52L2PQ8NGH6 319 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 UBALD1Q8TB05 177 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SAT2Q96F10 170 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SNX22Q96L94 193 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 LINC00052Q96N35 136 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 GAFA1Q96PS6 74 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SPIN2AQ99865 258 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRC-210ENST00000462363 DCTN5Q9BTE1 182 aa4.69□□□□□ -1.66
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