RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 ACY3Q96HD9 319 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR7D2Q96RA2 312 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL2L14Q9BZR8 327 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CEP170Q5SW79 1584 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PRR14LQ5THK1 2151 aa2.94□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM210A6NLX4 147 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LEUTXA8MZ59 168 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BSA7 217 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 M0R036 132 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 COPEO14579 308 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF708P17019 499 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GDI2P50395 445 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GABARAPL2P60520 117 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 RBX1P62877 108 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 COMMD7Q86VX2 200 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CALHM3Q86XJ0 350 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 NATD1Q8N6N6 113 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR1M1Q8NGA1 313 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR2V1Q8NHB1 315 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 TMBIM1Q969X1 311 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OPTNQ96CV9 577 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 STACQ99469 402 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 POLR1DQ9Y2S0 133 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR51B4Q9Y5P0 310 aa2.93□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 B4DEV8 164 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GPR75O95800 540 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR13C7P0DN81 318 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CEBPGP53567 150 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LINC00313P59037 77 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 C1orf195Q5TG92 126 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZFAND6Q6FIF0 208 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR8K1Q8NGG5 319 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF286AQ9HBT8 521 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 DKKL1Q9UK85 242 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ICOSQ9Y6W8 199 aa2.92□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR6C70A6NIJ9 312 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 DCTN3O75935 186 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 REG1AP05451 166 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 IL3P08700 152 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS17P08708 135 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CTXN2P0C2S0 81 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR12D1P0DN82 309 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ORM2P19652 201 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 LSM6P62312 80 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 RPS24P62847 133 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 GNA13Q14344 377 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 EBPQ15125 230 aaKnown RBP2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PDGFRLQ15198 375 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 NAA40Q86UY6 237 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SGPP2Q8IWX5 399 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF567Q8N184 647 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf22Q8N5N4 141 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 OR11G2Q8NGC1 345 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 CHMP6Q96FZ7 201 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PSTPIP2Q9H939 334 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 PLCH2O75038 1416 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 EVC2Q86UK5 1308 aa2.91□□□□□ -1.94
RABGGTB-205ENST00000462042 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BMM0 161 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 H3BQ85 93 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TRAPPC3O43617 180 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 GYPCP04921 128 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 FBP1P09467 338 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 OR4A8P0C604 315 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 MYL12AP19105 171 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 REG1BP48304 166 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC35A2P78381 396 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 PDK2Q15119 407 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CLVS2Q5SYC1 327 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RPRMLQ8N4K4 120 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF680Q8NEM1 530 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 C16orf78Q8WTQ4 265 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 UBE2WQ96B02 151 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC42Q96M95 316 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 MED28Q9H204 178 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 OR51V1Q9H2C8 321 aa2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
RABGGTB-205ENST00000462042 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
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