RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ADAM20O43506 726 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL13O43927 109 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PGA5P0DJD9 388 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR5R1Q8NH85 324 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MISP3Q96FF7 219 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNJ16Q9NPI9 418 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR2W1Q9Y3N9 320 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 EREGO14944 169 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 KBTBD11O94819 623 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS19P49795 217 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SRPXP78539 464 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SERF2P84101 59 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRB2Q8N423 598 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BEND2Q8NDZ0 799 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ2Q96H96 371 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC74BQ96LY2 380 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 P2RX4Q99571 388 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 S100A13Q99584 98 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DEFB126Q9BYW3 111 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NR2C1P13056 603 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DDTP30046 118 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RNFT1Q5M7Z0 435 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 LINC01551Q86U37 167 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF610Q8N9Z0 462 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP5SQ99766 215 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DLL3Q9NYJ7 618 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CA14Q9ULX7 337 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MEMO1Q9Y316 297 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF737O75373 536 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HLA-HP01893 362 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SP1P08047 785 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NUBP1P53384 320 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CLRN1P58418 232 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF266Q14584 549 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IL11RAQ14626 422 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR10D3Q8NH80 312 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM213BQ8TBF2 198 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB1CQ92928 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF488Q96MN9 340 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR6C1Q96RD1 312 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RPL23P62829 140 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 IMMP2LQ96T52 175 aa3.04□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 B4DEV8 164 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 F10P00742 488 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SELENOTP62341 195 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 COL10A1Q03692 680 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RAB30Q15771 203 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TEX38Q6PEX7 206 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM183AQ8IXX5 376 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFAF3Q9BU61 184 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RBKSQ9H477 322 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 OR1A1Q9P1Q5 309 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RRHO14718 337 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 DDB2Q92466 427 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C11orf52Q96A22 123 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PKIBQ9C010 78 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 RARRES3Q9UL19 164 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 WDR83OSQ9Y284 106 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNGR2O43760 224 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CA6P23280 308 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PNKDQ8N490 385 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C14orf166Q9Y224 244 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA12Q86UK0 2595 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BORCS7-ASMTA0A0B4J1R7 106 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CD300LBA8K4G0 201 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 C15orf62A8K5M9 175 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN34H7C241 214 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 MDH2P40926 338 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CAMLGP49069 296 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 CR1LQ2VPA4 569 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SUMF1Q8NBK3 374 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 BORCS8Q96FH0 119 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 TECTBQ96PL2 329 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 SNHG12Q9BXW3 62 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 METTL7AQ9H8H3 244 aa3.03□□□□□ -1.92
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.03□□□□□ -1.92
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