RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395788.3

C6orf48-208, Transcript of chromosome 6 open reading frame 48, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene C6orf48, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf48-208ENST00000395788 LGI3Q8N145 548 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF561Q8N587 486 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 KCNRGQ8N5I3 272 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CLEC18CQ8NCF0 446 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ZBTB34Q8NCN2 500 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR10V1Q8NGI7 309 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR5D13Q8NGL4 314 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR11L1Q8NGX0 322 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LHFPL5Q8TAF8 219 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LINC01560Q8TB33 94 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CORO2AQ92828 525 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 IL22RA2Q969J5 263 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC46Q96FV0 321 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SEC22AQ96IW7 307 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR10C1Q96KK4 312 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TP53RKQ96S44 253 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM222Q9H0R3 208 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 DNTTIP1Q9H147 329 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 KCNJ16Q9NPI9 418 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CCL28Q9NRJ3 127 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 RDH8Q9NYR8 311 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PRR13Q9NZ81 148 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 KCNIP1Q9NZI2 227 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR1A1Q9P1Q5 309 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 RNF115Q9Y4L5 304 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 U3KQ87 197 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ATRXP46100 2492 aa5□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV39A0A0B4J263 110 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 A0A0D9SG52 128 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 C5orf51A6NDU8 294 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 MPTX1A8MV57 137 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TMEM178BH3BS89 294 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 L7N2F9 121 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LGALS8O00214 317 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SIGLEC5O15389 551 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PLAUP00749 431 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 HBZP02008 142 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TFF1P04155 84 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 F2RP25116 425 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 S100A11P31949 105 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CD80P33681 288 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LUMP51884 338 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 P2RX3P56373 397 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TLE1Q04724 770 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PRSS54Q6PEW0 395 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TMUB2Q71RG4 321 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TBC1D26Q86UD7 250 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF546Q86UE3 836 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CMTM1Q8IZ96 169 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ZNF565Q8N9K5 539 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR5T2Q8NGG2 359 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR8H1Q8NGG4 311 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR13A1Q8NGR1 328 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 OR1L1Q8NH94 360 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SECTM1Q8WVN6 248 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 NEUROG1Q92886 237 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 GALMQ96C23 342 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 C14orf79Q96F83 325 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 GAFA1Q96PS6 74 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PDCD10Q9BUL8 212 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 COMMD9Q9P000 198 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 DNAJB11Q9UBS4 358 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 GAB2Q9UQC2 676 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TMED3Q9Y3Q3 217 aa4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PCNX1Q96RV3 2341 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 TUBAL3A6NHL2 446 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LRRC30A6NM36 301 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 ARPC5O15511 151 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SPINT2O43291 252 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 YPEL1O60688 119 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 IFNA21P01568 189 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 HOXB5P09067 269 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SLC25A6P12236 298 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 IGFBP2P18065 325 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 S100GP29377 79 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 SSTR2P30874 369 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 CEACAM6P40199 344 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 GABRA2P47869 451 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 PPOXP50336 477 aa4.98□□□□□ -1.61
C6orf48-208ENST00000395788 LOXL3P58215 753 aa4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms