RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYCP1Q15431 976 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 USF2Q15853 346 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 EXOC3L4Q17RC7 722 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC121Q6ZUS5 278 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DOLPP1Q86YN1 238 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C17orf78Q8N4C9 275 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPERTQ8NA61 448 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR11H1Q8NG94 326 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR10A6Q8NH74 314 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf78Q8WTQ4 265 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMIGD2Q96BF3 282 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAMM41Q96BW9 452 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MGLLQ99685 303 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF426Q9BUY5 554 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C11orf1Q9H5F2 150 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C16orf95Q9H693 158 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBQLN4Q9NRR5 601 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHMP5Q9NZZ3 219 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00527Q9UJ94 153 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSMD13Q9UNM6 376 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ALG5Q9Y673 324 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP3K19Q56UN5 1328 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CR1P17927 2039 aa0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP0.81□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRCP1A6NGW2 1772 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 F5H5K5 113 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 K7ERQ8 282 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 YKT6O15498 198 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MPZL2O60487 215 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LY6HO94772 140 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 BRI3O95415 125 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 GZMBP10144 247 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A16P16260 332 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD36P16671 472 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDK2P24941 298 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPRM1P35372 400 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD200P41217 278 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 HADHBP55084 474 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLX6P56179 175 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSPEAR-AS2P59090 65 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 RASL11AQ6T310 242 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR51H1Q8NH63 302 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 DCANP1Q8TF63 244 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ABHD14BQ96IU4 210 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM56Q96MV1 263 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBX5Q99593 518 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 Q9BRP9 147 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED18Q9BUE0 208 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MND1Q9BWT6 205 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52A5Q9H2C5 316 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL4A2P08572 1712 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SDK1Q7Z5N4 2213 aa0.8□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIFINA4D1Z8 144 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LINC00862A6NCI5 91 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C9J4A7 227 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 H3BPC8 53 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK16O75716 305 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV3-27P01718 113 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD7P09564 240 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESDP10768 282 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ORM2P19652 201 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYT1P21579 422 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP6V0CP27449 155 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 AGTR1P30556 359 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1E2P47887 323 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 STC1P52823 247 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTBP60709 375 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACTG1P63261 375 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1DQ13901 141 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LGALS9CQ6DKI2 356 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM75Q8N9X5 138 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR4X1Q8NH49 305 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 FNDC9Q8TBE3 224 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR52B2Q96RD2 323 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 PECRQ9BY49 303 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED28Q9H204 178 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ASCL3Q9NQ33 180 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 HHLA2Q9UM44 414 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLUHO75153 1309 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MED13Q9UHV7 2174 aa0.79□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAMB2P55268 1798 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYO5BQ9ULV0 1848 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0G2JQZ4 141 aa0.78□□□□□ -2.28
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM235A6NFC5 223 aa0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms