RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 PSPNO60542 156 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CA11O75493 328 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV1-44P01699 117 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR13C7P0DN81 318 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CAV2P51636 162 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR10A3P58181 314 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ASPHD2Q6ICH7 369 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TEX38Q6PEX7 206 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZFAND1Q8TCF1 268 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DYRK2Q92630 601 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 MALSU1Q96EH3 234 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 SIGLEC9Q9Y336 463 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 SEC14L6B5MCN3 397 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 J3QRE1 110 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 OR2F2O95006 317 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 NPBWR1P48145 328 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 CTF1Q16619 201 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF260Q3ZCT1 412 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LRRTM1Q86UE6 522 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RTN4RL2Q86UN3 420 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A42Q86VD7 318 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PIP4P2Q8N4L2 257 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 POC1AQ8NBT0 407 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR14K1Q8NGZ2 314 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LGALS14Q8TCE9 139 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RDH8Q9NYR8 311 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 FRRS1LQ9P0K9 344 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 WASHC3Q9Y3C0 194 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 SLC22A5O76082 557 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 IL1AP01583 271 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR5G3P0C626 314 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2E1P51965 193 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 RAB11AP62491 216 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MAB21L1Q13394 359 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SLC9A3R2Q15599 337 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 C3orf36Q3SXR2 165 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PPP1R27Q86WC6 154 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LILRB2Q8N423 598 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR4S2Q8NH73 311 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 SCGB1C1Q8TD33 95 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PHYHIPQ92561 330 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 BSCL2Q96G97 398 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 MMP28Q9H239 520 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 POFUT1Q9H488 388 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MOB4Q9Y3A3 225 aa3.68□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 A6NJ64 397 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PRR32B1ATL7 298 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MLNRO43193 412 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 LANCL1O43813 399 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 MOSP00540 346 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CLEC2LP0C7M8 214 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 EGR1P18146 543 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 F2RP25116 425 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HIST3H3Q16695 136 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM200BQ69YZ2 307 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 OR51A4Q8NGJ6 313 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa3.67□□□□□ -1.82
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PTPRC-201ENST00000348564 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OR4C45A6NMZ5 311 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 M0R1W7 72 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 GOSR2O14653 212 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 OGG1O15527 345 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 HOXB5P09067 269 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A6P0DMU7 189 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRC-201ENST00000348564 CT45A5P0DMU8 189 aa3.67□□□□□ -1.82
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