RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 H3BQ15 152 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 HYPMO75409 117 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 DLX1P56177 255 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 EBLN2Q6P2I7 272 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PP11 408 aa19.37■□□□□ 0.69
PTPRM-201ENST00000332175 GZMMP51124 257 aa19.37■□□□□ 0.69
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PTPRM-201ENST00000332175 SRXN1Q9BYN0 137 aa19.33■□□□□ 0.68
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PTPRM-201ENST00000332175 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 MMP9P14780 707 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 TBX15Q96SF7 602 aa19.32■□□□□ 0.68
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PTPRM-201ENST00000332175 HSPB8Q9UJY1 196 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 LOC102724200A0A096LPH7 203 aaPredicted RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa19.32■□□□□ 0.68
PTPRM-201ENST00000332175 IGKV3-11P04433 115 aa19.32■□□□□ 0.68
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