RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324659.12

NLRC3-201, Transcript of NLR family CARD domain containing 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NLRC3, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3-201ENST00000324659 VSIRQ9H7M9 311 aa10.32□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PPP5D1E7EU14 171 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 FGF5P12034 268 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 FKBP2P26885 142 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM211Q6ICI0 200 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 OR10D3Q8NH80 312 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 IL22RA2Q969J5 263 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 DOCK11Q5JSL3 2073 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 A0A087WWC5 75 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 OR6C6A6NF89 314 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CBR3O75828 277 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ERVFC1-1P60608 527 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 OR1K1Q8NGR3 316 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SDSLQ96GA7 329 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 C12orf49Q9H741 205 aa10.31□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 C5orf49A4QMS7 147 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 METTL15P1P0C7V9 234 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 IRF2P14316 349 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 LMO1P25800 156 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 RAC3P60763 192 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 WDR5BQ86VZ2 330 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 FKBP11Q9NYL4 201 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CEBPZOSA8MTT3 80 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SELEP16581 610 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 UCP3P55916 312 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TLE4Q04727 773 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PRSS8Q16651 343 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 MAJINQ3KP22 176 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ADGRG7Q96K78 797 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SIGLEC12Q96PQ1 595 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TUBG2Q9NRH3 451 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SYNGR1O43759 233 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 GCGP01275 180 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PSG2P11465 335 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SRPXP78539 464 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ZXDAP98168 799 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PRDX4Q13162 271 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 DOCK10Q96BY6 2186 aa10.3□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 NCKAP5O14513 1909 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF732B4DXR9 585 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 IFNA5P01569 189 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SERPINE2P07093 398 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 VDAC1P21796 283 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 RPS16P62249 146 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM42Q69YG0 159 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 C20orf204Q6ZNR8 217 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TBX15Q96SF7 602 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 DEFB127Q9H1M4 99 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 C11orf1Q9H5F2 150 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 GPR35Q9HC97 309 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PAM16Q9Y3D7 125 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PPIAL4AQ9Y536 164 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF716A6NP11 495 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ASCL4Q6XD76 172 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SLC35E3Q7Z769 313 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 R3HDM4Q96D70 268 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM56Q96MV1 263 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 OR5B12Q96R08 314 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ATP5SQ99766 215 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 Q9N2K0 584 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TAAR3PQ9P1P4 343 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 A0A1B0GUS0 222 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PRSS47A8MTI9 375 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CEACAM1P13688 526 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 ZNF787Q6DD87 383 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TOMM20LQ6UXN7 152 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 Q6ZSR3 168 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CPT1CQ8TCG5 803 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 SGCZQ96LD1 299 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 IMMP1LQ96LU5 166 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PLK3Q9H4B4 646 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 RPRMQ9NS64 109 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 MTCH1Q9NZJ7 389 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 KCNS2Q9ULS6 477 aa10.29□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CADP27708 2225 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TRAPPC2LH3BP13 241 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 AQP7O14520 342 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 CELA3AP09093 270 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 PAX9P55771 341 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TESK1Q15569 626 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 NMSQ5H8A3 153 aa10.28□□□□□ -0.76
NLRC3-201ENST00000324659 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms