RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000253462.7

GINS2-201, Transcript of GINS complex subunit 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS2, Length 2,673 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PR64 198 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PRV1 198 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 H3BP45 60 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 TFF1P04155 84 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 LMO1P25800 156 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 ZNF718Q3SXZ3 478 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 OR51H1Q8NH63 302 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 BCL2L14Q9BZR8 327 aa13.58□□□□□ -0.23
GINS2-201ENST00000253462 PLCE1Q9P212 2302 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 A0A1W2PPE2 198 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 CHST1O43916 411 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KIR2DS4P43632 304 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 CEBPGP53567 150 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KIR2DS1Q14954 304 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KRTCAP3Q53RY4 240 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PCSK4Q6UW60 755 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 Q6ZS49 121 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 FAM57AQ8TBR7 257 aa13.58□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TUSC2O75896 110 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 FBP1P09467 338 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 VAMP2P63027 116 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 FAM27E3Q08E93 113 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 NMSQ5H8A3 153 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 VHLLQ6RSH7 139 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 LRP11Q86VZ4 500 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 FAM24BQ8N5W8 94 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TIMP3P35625 211 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 MSMPQ1L6U9 139 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 C22orf34Q6ZV56 151 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 C11orf53Q8IXP5 236 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 FAM185AQ8N0U4 392 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 LYRM2Q9NU23 88 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PTAFRP25105 342 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 HAGHQ16775 308 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 Q8IYB0 196 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SLC35B3Q9H1N7 401 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KCNJ16Q9NPI9 418 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TAAR3PQ9P1P4 343 aa13.57□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 UCP1P25874 307 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SRPXP78539 464 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 COMMD1Q8N668 190 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 Q8NA96 180 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 OR1A1Q9P1Q5 309 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ROS1P08922 2347 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TMEM210A6NLX4 147 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SH2D1BO14796 132 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PITX3O75364 302 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TBR1Q16650 682 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 EGLN1Q9GZT9 426 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 CXXC4Q9H2H0 198 aa13.56□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 KITLGP21583 273 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 RAB5CP51148 216 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PAX9P55771 341 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 RAB5BP61020 215 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 RND3P61587 244 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ID3Q02535 119 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 HMGN3Q15651 99 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TIMM23BQ5SRD1 257 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 DOLPP1Q86YN1 238 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 OR2Z1Q8NG97 314 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 OR10J5Q8NHC4 309 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 MUCL1Q96DR8 90 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PSPNO60542 156 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 HAND1O96004 215 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PSG2P11465 335 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 VDAC1P21796 283 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SULT1A1P50225 295 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 HLA-DRB3P79483 266 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ZNF146Q15072 292 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SPIN2AQ99865 258 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 IFT22Q9H7X7 185 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 SSUH2Q9Y2M2 353 aa13.55□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 OR2B8PP59922 312 aa13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 NHLH1Q02575 133 aa13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ZNF266Q14584 549 aa13.54□□□□□ -0.24
GINS2-201ENST00000253462 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms