RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	ZDHHC11	Q9H8X9	412 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659		Q9N2K0	584 aa		13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	DIRAS3	O95661	229 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	IFNA1	P01562	189 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM225B	P0DP42	221 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	BCL2	P10415	239 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	GNG10	P50151	68 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	RAB11A	P62491	216 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	FAM57B	Q71RH2	274 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CCDC71L	Q8N9Z2	235 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	FOXB1	Q99853	325 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PECR	Q9BY49	303 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	C11orf1	Q9H5F2	150 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	OR4A8	P0C604	315 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	VAMP2	P63027	116 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	C3AR1	Q16581	482 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TSPO2	Q5TGU0	170 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	OR5AS1	Q8N127	324 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PGAM5	Q96HS1	289 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	NECAP2	Q9NVZ3	263 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF319	Q9P2F9	582 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	NAT8	Q9UHE5	227 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	NAGK	Q9UJ70	344 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	GAB2	Q9UQC2	676 aa		13.11	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659		F5H5K5	113 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CEACAM4	O75871	244 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TYMS	P04818	313 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF728	P0DKX0	622 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	B4GALT1	P15291	398 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CCL1	P22362	96 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	OR3A4P	P47883	348 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PMP22	Q01453	160 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	RNPS1	Q15287	305 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ACTL10	Q5JWF8	245 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	RTN4RL2	Q86UN3	420 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	RTN4IP1	Q8WWV3	396 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	BANF2	Q9H503	90 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	CALHM2	Q9HA72	323 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	LPAR2	Q9HBW0	351 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	GVINP1	Q7Z2Y8	2422 aa		13.1	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	DOK3	Q7L591	496 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	COMMD2	Q86X83	199 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SPTSSA	Q969W0	71 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	GPER1	Q99527	375 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	POLR3K	Q9Y2Y1	108 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPQ1	181 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SOX15	O60248	233 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SCGB1D1	O95968	90 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	UCP3	P55916	312 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	TAS2R30	P59541	319 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	COL5A1-AS1	Q5SY13	56 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	FBXW9	Q5XUX1	488 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SSC4D	Q8WTU2	575 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ANAPC16	Q96DE5	110 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	PLK3	Q9H4B4	646 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A10	Q9NS82	523 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF701	Q9NV72	531 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.09	□□□□□ -0.31
BBS1-225	ENST00000630659	MED19	A0JLT2	244 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659		M0R135	149 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	SYNGR3	O43761	229 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF32	P17041	273 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	ANOS1	P23352	680 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	DTYMK	P23919	212 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	BRS3	P32247	399 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	RPL29	P47914	159 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	PCBD1	P61457	104 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.08	□□□□□ -0.32
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF705A	Q6ZN79	300 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32

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