RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 SULT1A4P0DMN0 295 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RPS2P15880 293 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RPL31P62899 125 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GNMTQ14749 295 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR11H7Q8NGC8 314 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10V1Q8NGI7 309 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R14BQ96C90 147 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC5A7Q9GZV3 580 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RAB9BQ9NP90 201 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 LPAR3Q9UBY5 353 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 MIOXQ9UGB7 285 aa20.58■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PIGPP57054 158 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ABCA11PQ4W5N1 156 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NINJ1Q92982 152 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PARP12Q9H0J9 701 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC2A9Q9NRM0 540 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TAS2R3Q9NYW6 316 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 JPT1Q9UK76 154 aa20.57■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SFT2D2O95562 160 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV4-39P01824 125 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 WNT2P09544 360 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 VAMP1P23763 118 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 COL8A1P27658 744 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 LUMP51884 338 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SPICQ8N5J4 248 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ST6GAL2Q96JF0 529 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CCL28Q9NRJ3 127 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 USF3Q68DE3 2245 aa20.56■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IGHV3-43DP0DP04 118 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 LOXL3P58215 753 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF273Q14593 569 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM200BQ69YZ2 307 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 MITD1Q8WV92 249 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR31O00270 319 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR37O15354 613 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CXCL3P19876 107 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PHLDA2Q53GA4 152 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NLRC3Q7RTR2 1065 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 SGPP2Q8IWX5 399 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR2AK2Q8NG84 335 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8B3Q8NGG8 313 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8B2Q96RD0 313 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 A8MV72 311 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 YPEL1O60688 119 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OMGP23515 440 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 RND3P61587 244 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 LTC4SQ16873 150 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 FAM185AQ8N0U4 392 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF525Q8N782 197 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 YPEL2Q96QA6 119 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TENM4Q6N022 2769 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 HSD17B6O14756 317 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8U9P0C7N5 309 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CD34P28906 385 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CD83Q01151 205 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TMEM30BQ3MIR4 351 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 MORN2Q502X0 79 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 BVESQ8NE79 360 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 OR8U1Q8NH10 309 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 CASTOR1Q8WTX7 329 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 NAA60Q9H7X0 242 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 GNG12Q9UBI6 72 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 F5H0A9 414 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 IGLV2-14P01704 120 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC9A3R2Q15599 337 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 UXS1Q8NBZ7 420 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GALNT14Q96FL9 552 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF714Q96N38 554 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 PHB2Q99623 299 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 GFOD1Q9NXC2 390 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MGAT4CQ9UBM8 478 aa20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 C2orf68Q2NKX9 166 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 CMTM1Q8IZ96 169 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 OR10A7Q8NGE5 316 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 OR52M1Q8NGK5 317 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 AKR1E2Q96JD6 320 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 A0A0B4J2A0 478 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 MPPED1O15442 326 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNA2P01563 188 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.1 ms