RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, human

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR3A3	P47888	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00205	P59089	165 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FXYD4	P59646	89 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARPC4	P59998	168 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BAMBI	Q13145	260 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CDK10	Q15131	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RUSC1-AS1	Q66K80	236 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HCP5	Q6MZN7	132 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IL17REL	Q6ZVW7	336 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		Q71RC1	249 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BORCS5	Q969J3	196 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	COX4I2	Q96KJ9	171 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF714	Q96N38	554 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TBX15	Q96SF7	602 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MMP28	Q9H239	520 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KCNIP1	Q9NZI2	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	EDAR	Q9UNE0	448 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FLVCR2	Q9UPI3	526 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00312	Q9Y6C7	94 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LRRK2	Q5S007	2527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR5H14	A6NHG9	310 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C17orf98	A8MV24	154 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162		A8MXK9	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HSD17B6	O14756	317 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LYRM1	O43325	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	FOXH1	O75593	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TGFA	P01135	160 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CD74	P04233	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MSMB	P08118	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CSF1	P09603	554 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	AKAIN1	P0CW23	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CEACAM6	P40199	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CBX5	P45973	191 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KCNJ3	P48549	501 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	NPY4R	P50391	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF134	P52741	427 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RAB25	P57735	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LOXL3	P58215	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TAS2R19	P59542	299 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ACTB	P60709	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ACTG1	P63261	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MRPS10	P82664	201 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ARL6IP1	Q15041	203 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PLA1A	Q53H76	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	C6orf183	Q5T699	404 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	LINC00299	Q6ZSB3	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	MOB1B	Q7L9L4	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	H1FOO	Q8IZA3	346 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	POC5	Q8NA72	575 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR51S1	Q8NGJ8	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR13C8	Q8NGS7	320 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CORO2A	Q92828	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	TOMM40L	Q969M1	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	DACT3	Q96B18	629 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ABHD14B	Q96IU4	210 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GINS4	Q9BRT9	223 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	ZNF2	Q9BSG1	426 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	RDH8	Q9NYR8	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	PRR13	Q9NZ81	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CAPNS1-208	ENST00000589162	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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