RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 APLNRP35414 380 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 KIR2DS4P43632 304 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 DLK1P80370 383 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 BAXQ07812 192 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ICAM4Q14773 271 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 KIR2DS1Q14954 304 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ZNF429Q86V71 674 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 C1QL4Q86Z23 238 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ZDHHC23Q8IYP9 409 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CLEC18CQ8NCF0 446 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 PRSS33Q8NF86 280 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ABHD14BQ96IU4 210 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 GGACTQ9BVM4 153 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ZNF407Q9C0G0 2248 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 DCAF16Q9NXF7 216 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 TAAR3PQ9P1P4 343 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 WSB1Q9Y6I7 421 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 TTC28Q96AY4 2481 aa9.72□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 C3orf80F5H4A9 247 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 PPIHO43447 177 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 TUSC2O75896 110 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 YIF1AO95070 293 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 SLC34A2O95436 690 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 TLE4Q04727 773 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CLN3Q13286 438 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CEACAM21Q3KPI0 293 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 SAXO1Q8IYX7 474 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 OR51H1Q8NH63 302 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ATP5SQ99766 215 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 TOLLIPQ9H0E2 274 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 CLCF1Q9UBD9 225 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 ATP23Q9Y6H3 246 aa9.71□□□□□ -0.85
GGA3-205ENST00000578348 A0A0G2JRQ6 117 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 H0Y980 276 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 HS3ST1O14792 307 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 SYNGR1O43759 233 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 PAX9P55771 341 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 SLC25A24Q6NUK1 477 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 C20orf204Q6ZNR8 217 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 MKXQ8IYA7 352 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 OR5D13Q8NGL4 314 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 Q8WTZ3 238 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 ZNF488Q96MN9 340 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RNF115Q9Y4L5 304 aa9.71□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 AQP7O14520 342 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CXCL1P09341 107 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 ELOBQ15370 118 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 ZNF674Q2M3X9 581 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 MPV17LQ2QL34 196 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 ZNF506Q5JVG8 444 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CLDND2Q8NHS1 167 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RDH5Q92781 318 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 DNAJC13O75165 2243 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CEACAM4O75871 244 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 NGFP01138 241 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CTXN2P0C2S0 81 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CEACAM1P13688 526 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 MMP9P14780 707 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 F2RP25116 425 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 NDUFA6P56556 154 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 TAS2R30P59541 319 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 ERVFRD-1P60508 538 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 DEFB109BQ30KR1 87 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 C9orf152Q5JTZ5 239 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 MDP1Q86V88 176 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 TVP23CQ96ET8 276 aa9.7□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 CD300LBA8K4G0 201 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 SERPINE2P07093 398 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 PSG2P11465 335 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 WNT5AP41221 380 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 IL24Q13007 206 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 PCSK4Q6UW60 755 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 IL1F10Q8WWZ1 152 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 GPR146Q96CH1 333 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 HIST1H2AAQ96QV6 131 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 GNG13Q9P2W3 67 aa9.69□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 A0A087WWC5 75 aa9.68□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 J3QW42 95 aa9.68□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 IFNA5P01569 189 aa9.68□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 HBE1P02100 147 aa9.68□□□□□ -0.86
GGA3-205ENST00000578348 RD3LP0DJH9 198 aa9.68□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms